Der Direktor, Prof. Dr. Konrad Steffen, trägt die Gesamtverantwortung für die WSL und ist gegenüber dem ETH-Rat für die Geschäftsführung verantwortlich. So entscheidet er über die Planung, Forschung, Lehre und Dienstleistungen der WSL, wobei er nach Anhörung der Direktion und der Betroffenen entscheidet.
Der stellvertretende Direktor, Dr. Christoph Hegg, leitet den Fachbereich Planung und Logistik und vertritt den Direktor in dessen Abwesenheit sowie in von ihm zugewiesenen Aufgaben und Kompetenzen. Zusammen bilden der Direktor und der stellvertretende Direktor die Geschäftsleitung, welche die operative Führung der WSL wahrnimmt.
Die Direktion plant die strategische Ausrichtung der WSL und unterstützt den Direktor bei der Leitung der WSL. Sie besteht aus folgenden Mitgliedern:
Die Leitenden der Facheinheiten Strategisches und operatives Controlling, Finanzen und HR sowie Kommunikation nehmen an den Direktionssitzungen in beratender Funktion teil.
Der Direktor und der stellvertretende Direktor werden bei ihrer Arbeit von folgenden Personen unterstützt:
Die Forschungskommission berät den Direktor in der Entwicklung der Forschungsstrategien und nimmt zuhanden der Direktion Stellung zu Forschungsgesuchen und Grossinvestitionen.
Folgende Personen sind Mitglied der Forschungskommission:
Die WSL-Informatik-Kommission (WIKOM) ist als ständige Kommission beratendes Organ der Direktion, das Entscheidungen für einheitsübergreifende (strategische) Angelegenheiten der Informationstechnologien vorbereitet.
Die Laborkommission (Labkom) unterstützt die Direktion der WSL bei Entscheidungsfindungen, welche den Betrieb in den WSL-eigenen Laboratorien betreffen.
Die PV gewährleistet die Mitsprache der Angestellten an der WSL. Sie besteht aus 9 Personen, die alle zwei Jahre vom Personal gewählt werden.