... a „Keep It Simple Species Migration model“ for R
Was ist KISSMig?
KISSMig ist ein einfaches, rasterbasiertes Modell für die dynamische Modellierung von Artverbreitungen in der Programmiersprache R. Ausgehend von einer Ursprungsverbreitung generiert KISSMig je nach Voreinstellung deterministsich oder stochastisch Artverbreitungen zu späteren Zeitpunkten unter konstanten oder sich ändernden Umweltbedingungen. Der Name bezieht sich auf das KISS-Prinzip und steht für ein einfaches und schnell ausführbares Modell zur dynamischen Modellierung von Artverbreitungen.
Wofür wird KISSMig genutzt?
Ein zentrales Ziel der Makroökologie und Biogeographie ist ein besseres Verständnis von Artverbreitungen. Dabei werden dynamische Aspekte wie die zeitlich verzögerte Migration von Arten bei Vorhersagen und Simulationen der früherer, aktuellen oder zukünftigen Verbreitung von Arten häufig vernachlässigt. Modelle, welche eine solche Dynamik explizit berücksichtigen, sind jedoch meist komplex und rechenintensiv. KISSMig bietet hier eine einfache Möglichkeit, dynamische Aspekte wie begrenzte Migration in die Modellierung von Artenverbreitungen zu integrieren (Nobis & Normand 2014).
KISSMig verwenden
KISSMig ist direkt in R als Package verfügbar oder kann über den untenstehenden Download-Link installiert werden. KISSMig erfordert keine Vorkenntnisse einer artspezifischen Migrationsrate, da diese je nach untersuchter Art und dem Aufbau der Analyse optimiert werden kann (Nobis & Normand 2014). Die einzigen Eingabedaten sind die geografische Ausgangsverbreitung, eine oder mehrere auf Umweltdaten basierende Eignungskarten und die Anzahl der simulierten Ausbreitungsschritte. Mit KISSMig kann jedoch auch die wahrscheinliche Ausgangsverbreitung einer Art bestimmt werden - beispielsweise Gebiete mit eiszeitlichen Refugien (Nobis & Normand 2014). Als Zusatz-Modul bei statistischen Artverbreitungsmodellen (SDMs) dient KISSMig dazu, limitierte Migration von Arten im Klimawandel zu analysieren (Subba et al. 2018, Liao et al. 2020). Einen Einstieg in die Verwendung von KISSMig liefert das R-Skript kissmig_examples.R.
Paläoklima
Die folgenden Downloads enthalten Paläoklimadaten mit einer zeitlichen Auflösung von 1000 Jahren über die letzten 21'000 Jahre seit der letzten Eiszeit wie sie in Nobis & Normand (2014) verwendet wurden. Nach dem Entpacken der zip-Dateien, kann die Mittlere Jahrestemperatur der mittlere Jahresniederschlag mit der stack-Funktion des raster-Package in R eingelesen werden.
- Paläoklima - mittlerer jährlicher Niederschlag (zip, 5 MB)
- Paläoklima - mittlere Jahrestemperatur (zip, 5 MB)
In der Zwischenzeit stehen mit CHELSA-TraCE21k (Karger et al. 2023) deutlich umfangreichere und höher aufgelöste Paläoklimadaten für die Analyse von Artverbreitungen seit der letzten Eiszeit weltweit zur Verfügung.