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Diversité génétique et génétique de la conservation

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La capacité des différentes espèces animales et végétales à bien s’adapter à leur environnement dépend de leur diversité génétique. Nous étudions les processus écologiques dans les populations de champignons, de plantes et d’animaux à l’aide de méthodes de génétique moléculaire et de recherches expérimentales.

Comment les plantes alpines s’adaptent-elles aux conditions environnementales changeantes? De quelle façon les routes influencent-elles l'expansion et l’interconnexion des populations? Comment la consanguinité affecte-t-elle les espèces rares? Les méthodes d’analyse génétique peuvent apporter des réponses à ces questions. À l’aide de ces méthodes et d’expériences, par exemple en serre, nous étudions les processus écologiques dans les populations végétales et animales, et déterminons les espèces à l’aide de leur ADN (ADNe). Lors de nos expériences, nous nous concentrons sur des espèces qui jouent un rôle écosystémique essentiel ou sont rares ou en danger. Nos résultats constituent des bases essentielles pour la planification et la mise en œuvre de mesures de protection de la nature et des espèces, mais également pour la sylviculture.

Thèmes

POUR EN SAVOIR PLUS

News

08.04.2021

Des scientifiques du WSL et de l'Eawag s'associent pour trouver des solutions aux défis urgents de la perte de biodiversité.

18.01.2021

Une étude montre que l’arolle semble être incapable de s’adapter rapidement au changement climatique et pourrait ainsi s’éteindre localement.

22.12.2020

Le projet GenTree sur les ressources génétiques des arbres forestiers, auquel le WSL a participé, a reçu le prix "Etoiles de l'Europe".

Projets

A range-wide transplant experiment using participatory science and genomic prediction

Politik Evaluation Biodiversität

Dieses Projekt ist durch die wiederholte Aussage der OECD legitimiert, dass die Biodiversitätspolitik eine Schwachstelle der Schweizer Umweltpolitik sei. Mit moderner Texterkennung evaluieren wir wie die Biodiversitätspolitik in der Schweiz implementiert wird.

Sécheresse et hêtres: effets à moyen terme de la sécheresse estivale de 2018 sur le hêtre sur le versant nord des Alpes

Dans ce projet, nous étudions les causes des impacts de l'extrême sécheresse de l'été 2018 sur la vitalité des hêtres dans différentes régions du Plateau suisse et du Jura.

eLTER Switzerland

The Long-Term Ecologiocal Research in Europe (LTER-Europe) capitalizes on research infrastructures such as the in-situ network of sites and information technology. Thousands of research projects have been carried out taking advantage of this infrastructure.

Schwierigkeiten bei der Umsetzung von Biodiversitätszielen

Wo liegen die Schwierigkeiten bei der Umsetzung von Zielen im Bereich Biodiversität und Landschaft? Eine Expertenumfrage gibt Auskunft.

Superstructures in turbulence

Large coherent vortices are easily distinguishable by human eye when looking at clouds in the sky or at the whirls of water in rivers and lakes. We develop coherent structure identification methods to detect these vortices and understand their role in mixing stratified flows in lakes and the ocean.

Oriental beech (Fagus orientalis) for assisted migration?

We assess the drought response of European and oriental across different life stages by taking advantage of existing Oriental beech plantations in France, Germany and Switzerland.

Past genetic diversity of Swiss mountain forests

Future climate change will have drastic effects on mountain forests. We will analyse ancient DNA preserved in natural archives to reconstruct the impact of past rapid climate change on the neutral and adaptive genetic diversity of trees.

Incitations dommageables à la Biodiversité

La situation de la biodiversité en Suisse est préoccupante. Cependant, ils existent encore diverses incitations et aide publique qui soutiennent financièrement les activités qui nuisent à la biodiversité. Ces incitations mauvaises doivent être éliminées ou reformulées. Dans ce but, il en faut une vue globale.

OakID2

Transferability and phylogenetic extension of species-diagnostic SNP markers in European white oak species

Global Distribution Patterns of Plants

In this project we use historic climate, phylogeny, functional data and a processed based simulation model to explain how eco-evolutionary processes have led to the contemporary biodiversity patterns.

The Megafauna project

This projects uses a non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach to assess the biodiversity of marine vertebrates in 200 sites to ultimately identify possible refugia for marine megafauna.

Chamois genetics

In this project, we will sample populations of R. rupicapra across the alpine massif and genotype them using RAD-sequencing. We will investigate the historical and contemporary factors shaping genetic variation within and among populations.

Molecular epidemiology of fungal invasions

In this project, we investigate the molecular epidemiology of invasive European populations of the chestnut blight fungus Cryphonectria parasitica.

Conserving the flora on erratic blocks

Erratic blocks form small siliceous habitats in the calcareous Swiss lowlands and Jura mountains, harbour special bryophytes and ferns and are endangered by bouldering and shading. The project creates the scientific basis for their conservation.

Tool kit conservation genetics

Partners from the private and academic sector joined to set up a ready-to-use tool kit, which allows authorities and consultancies to apply conservation genetic methods in a standardized way in their everyday work.

Metalink

Soil contamination with heavy metals is a widespread problem affecting natural, cultivated, urban and industrial sites throughout Europe. The main objective in this Swiss/Polish collaboration project is to characterize the links between environmental, genotypic, and phenotypic features in the metal-tolerant plant model Arabidopsis halleri.

GenTree

GenTree aims at providing the European forestry sector with better knowledge, methods and tools for optimizing the management and sustainable use of forest genetic resources in Europe in the context of climate change and continuously evolving demands for forest products and services.

PiCadapt

Das SNF-Projekt PiCadapt untersucht die Variation in Genen der Arve in Bezug auf die Anpassung entlang Umweltgradienten.

GeneScale

GeneScale beschreibt genetische Variation im Genom der Alpen-Gänsekresse (Arabis alpina) und sucht nach Hinweisen auf lokale Anpassung an kleinsträumige Umweltbedingungen.

Populationsökologie des Schneehasen

Wir untersuchen die Verbreitung, Abundanz und Dynamik einer Schneehasenpopulation in einem geschützten Alpinen Ökosystem mit jährlichen Feldaufnahmen und nicht-invasiven genetischen Methoden.

Strukturelle Vielfalt und Biodiversität

Ist strukturelle Vielfalt eine wichtige Voraussetzung für eine reichhaltige Waldbiodiversität? Diese Frage steht im Zentrum dieser Studie.

QuercAdapt

Wir untersuchen den Zusammenhang zwischen genetischer Variation und Umweltfaktoren, bei drei einheimischen Eichenarten. Damit evaluieren wir die Angepasstheit verschiedener Arten und Herkünfte – ein wichtiger waldbaulicher Aspekt angesichts des sich verändernden Klimas.

Chalarose du frêne

Les frênes en Europe sont actuellement massivement affectés dans leur développement par la chalarose du frêne. Notre but est la caractérisation de virus fongiques dans l’agent pathogène de la chalarose du frêne Chalara fraxinea et évaluation de leur utilité potentielle dans la lutte biologique contre la maladie.

Disentangling truffle ecology

We study the complex biotic and abiotic ecology and the population genetics of the Burgundy truffle (Tuber aestivum) in Switzerland and the German pre-Alps, with particular emphasis on the ecological and climatological drivers for the productivity and phenology of this most valuable truffle species.

Chestnut blight

The introduced chestnut blight fungus Cryphonectria parasitica causes severe damage to chestnut forests and orchards across Europe. We investigate the biology and epidemiology of the disease and provide the scientific basis for biological control.

Phytophthora genetics

Within the cosmopolitan plant pathogenic species Phytophthora citricola, high levels of morphological and molecular variation were previously observed. Recently, DNA analyses revealed that the P. citricola complex actually includes four species, namely P. multivora, P. plurivora, P. citricola I, and P. citricola sensu strictu, which show different geographic distributions and host ranges.

Revision der Roten Liste der Farn- und Blütenpflanzen

In der Begleitstudie zur Revision der Roten Liste der Farn- und Blütenpflanzen wird überprüft, ob statistische Methoden als Hilfsmittel bei der Erstellung und bei der Qualitätskontrolle von Roten Listen sinnvoll eingesetzt werden können.

Klimawandel und Waldvögel

In diesem Projekt untersuchen wird die direkten und indirekten Auswirkungen der Klimawandels auf die realisierten ökologischen Nischen von Habitatspezialisten des Gebirgswaldes, indem wir die strukturellen und vegetationsspezifischen Lebensraumveränderungen entlang eines Klimagradienten erheben.

AVE

Das Hauptziel dieses SNF-finanzierten SINERGIA-Projektes ist es, adaptativ genetische Diversität zu charakterisieren, welche mit unterschiedlichen Standortfaktoren in natürlichen Populationen verwandter Pflanzenarten im Zusammenhang steht.

Arve und Tannenhäher

Molekulargenetische Vater- und Mutterschaftsanalysen an jungen Arven, die aus den Verstecken des Tannenhähers gekeimt sind, können aufzeigen, wie sich diese Ausbreitung auf die genetische Struktur zukünftiger Arvenpopulationen auswirkt.

Evoltree

A large network of research institutions collaborates within an EC-funded Network of Excellence to study the impacts of climate change on forest ecosystems from an evolutionary perspective.

IntraBioDiv

Dans le cadre d’un projet européen, des scientifiques du WSL étudient les possibles corrélations entre la diversité intraspécifique et la richesse en espèces et en habitats. Ils ont pour objectifs de mettre en évidence et d’expliquer les relations possibles entre différents niveaux de biodiversité.

Populationsmodell Auerhuhn

Die Bestände der Raufusshühner sind rückläufig und deshalb soll ihren Habitatansprüchen auf waldbaulicher Seite vermehrt Rechnung getragen werden.

Tundra Experiment

Au cours des dernières décennies, les températures ont augmenté plus rapidement dans les régions arctico-alpines que dans les autres régions. Comment les écosystèmes des toundras réagissent-ils à ce réchauffement climatique? Le SLF fait partie d'un réseau international de recherche qui étudie, dans une quarantaine d’endroits dans le monde, comment les plantes adaptées au froid réagissent face à des températures plus élevées.

WATER - within the EVOLTREE network

A network of four research institutions collaborates within an EC-funded Network of Excellence to determine and understand the influence of genetic diversity of trees and site water regime on neutral and functional diversities of the associated mycorrhizal community.

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Contact

Prof. Dr. Rolf Holderegger

membre du Conseil de direction, chef d'unité de recherche

Biodiversité et écologie de la conservation

rolf.holderegger(at)wslto make life hard for spam bots.ch

+41 44 739 25 27+41 44 739 25 27

Birmensdorf

Dr. Felix Gugerli Künzle

senior scientist, vice-chef de groupe

Biodiversité et écologie de la conservation

Génétique écologique

felix.gugerli(at)wslto make life hard for spam bots.ch

+41 44 739 25 90+41 44 739 25 90

Birmensdorf

PD Dr. Janine Bolliger

collaboratrice scientifique

Dynamique du paysage

Systèmes d'utilisation du territoire

janine.bolliger(at)wslto make life hard for spam bots.ch

+41 44 739 23 93+41 44 739 23 93

Birmensdorf

Dr. Christian Rellstab

collaborateur scientifique

Biodiversité et écologie de la conservation

Génétique écologique

christian.rellstab(at)wslto make life hard for spam bots.ch

+41 44 739 25 42+41 44 739 25 42

Birmensdorf

Prof. Dr. Christoph Scheidegger

chef de groupe, senior scientist

Biodiversité et écologie de la conservation

Biodiversité

christoph.scheidegger(at)wslto make life hard for spam bots.ch

+41 44 739 24 39+41 44 739 24 39

Birmensdorf

Services et produits

Contrôle des mesures de mise en réseau

Les mesures de mise en réseau visent à rétablir l'échange d'individus entre populations isolées

Responsable: Rolf Holderegger

Lecture: Conservation Genetics

The course deals with conservation genetics and its practical applications. It introduces the genetic theories of conservation genetics, such as inbreeding depression in small populations or fragmentation. The course also shows how genetic methods such as eDNA and metabarcoding are used in conservation management, and it critically discusses the benefits and limits of conservation genetics.

Organisateur/trice: ETH Zurich

Responsable: Rolf Holderegger , Felix Gugerli Künzle

Lecture: Genomics of Environmental Adaptation

This five-day winter school aims at teaching advanced Master students, PhD students and post-doctoral researchers on aspects of the genomics of environmental adaptation. It provides both theoretical background and hands-on exercises on major topics of contemporary environmental genomics such as signatures of selection, outlier analysis or environmental association analysis.

Organisateur/trice: ETH Zürich

Responsable: Rolf Holderegger , Felix Gugerli Künzle , Christian Rellstab

Lecture: Tree Genetics - Concepts and Applications

Trees are important elements and drivers of ecosystem processes in forests and landscapes. Tree species diversity and intraspecific genetic diversity are relevant factors for continuous adaptation, required for a sustainable maintenance of forest products and services. Sustainable forest and landscape management under climate change has to take forest genetic resources into consideration.

Organisateur/trice: ETH Zurich

Responsable: Felix Gugerli Künzle , Peter Brang , Christoph Sperisen , Simone Prospero , Martina Peter

Vidéo: Le piège à spores

Le piège des spores situé sur l’aire du WSL à Birmensdorf fait partie d’un projet mondial de monitoring. À l’heure actuelle, seules 150 000 espèces fongiques sont décrites scientifiquement, on table en revanche sur la présence effective de deux à 13,2 millions d’espèces. Le projet de monitoring doit permettre d’affiner ces estimations.

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