Prof. Dr. Rolf Holderegger
Funktion
Mitglied der Direktion, Leiter Forschungseinheit
Forschungseinheiten
Kontakt
Eidg. Forschungsanstalt WSL
Zürcherstrasse 111
8903 Birmensdorf
Standort
Birmensdorf Bi MG C 29
Current position
Acting Deputy Director WSL
Adjunct Professor at ETH Zürich, lecturing on conservation biology, conservation genetics, landscape genetics and ferns
Head of Research Unit Biodiversity and Conservation Biology
Member of WSL directorate
Previous positions
2006-2010 | Head of Research Unit Ecological Genetics and Evolution WSL |
2001-2006 | Deputy Head of Section Ecological Genetics WSL |
1998-1999 | Postdoc at University of St Andrews, Scotland |
1997-1998 | Research Associate at Institute of Systematic Botany, University of Zürich |
1997 | PhD at University of Zürich |
Research interests
My research interests are in biodiversity and conservation biology, in particular ecological genetics and genomics. Of special relevance are the interface between research and application/outreach and the implementation of scientific results in conservation management and landscape planning. I study a wide array of organisms and use a suite of methods, i.e. descriptive and experimental field data and genetic and genomic approaches. During the last years, I spent effort in promoting landscape genetics by organizing international symposia, editing special issues, delivering keynotes, teaching and writing review papers. In several landscape genomic projects on alpine plants, I identify genomic regions of adaptation by using next generation sequencing data and environmental association analysis. I also supervise the large monitoring program of the nationally important habitats of Switzerland (WBS).
Other activities
Member of the steering board of the Rübel Foundation
Scientific advisory board (OFU) of the Swiss Federal Office for the Environment (BAFU)
Steering Board of the Genetic Diversity Centre GDC at ETH Zürich
Complete publication list
- Complete publication list Rolf Holderegger May 2019: PDF
FURTHER INFORMATION
Publications WSL
Scientific publication article peer reviewed
Rellstab, C.; Zoller, S.; Sailer, C.; Tedder, A.; Gugerli, F.; Shimizu, K.K.; Holderegger, R.; Widmer, A.; Fischer, M.C., 2020: Genomic signatures of convergent adaptation to Alpine environments in three Brassicaceae species. Molecular Ecology, 29, 22: 4350-4365. doi: 10.1111/mec.15648
Hepenstrick, D.; Bergamini, A.; Holderegger, R., 2020: The distribution of climbing chalk on climbed boulders and its impact on rock-dwelling fern and moss species. Ecology and Evolution, 10, 20: 11362-11371. doi: 10.1002/ece3.6773
Holderegger, R.; Schmidt, B.R.; Grünig, C.; Meier, R.; Csencsics, D.; Gassner, M.; Rellstab, C.; Stapfer, A., 2020: Ready-to-use workflows for the implementation of genetic tools in conservation management. Conservation Genetics Resources, 12: 691-700. doi: 10.1007/s12686-020-01165-5
Dauphin, B.; Wüest, R.O.; Brodbeck, S.; Zoller, S.; Fischer, M.C.; Holderegger, R.; Gugerli, F.; Rellstab, C., 2020: Disentangling the effects of geographic peripherality and habitat suitability on neutral and adaptive genetic variation in Swiss stone pine. Molecular Ecology, 29, 11: 1972-1989. doi: 10.1111/mec.15467
Jamin, A.; Peintinger, M.; Gimmi, U.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2020: Evidence for a possible extinction debt in Swiss wetland specialist plants. Ecology and Evolution, 10, 3: 1264-1277. doi: 10.1002/ece3.5980
Fabian, Y.; Bollmann, K.; Brang, P.; Heiri, C.; Olschewski, R.; Rigling, A.; Stofer, S.; Holderegger, R., 2019: How to close the science-practice gap in nature conservation? Information sources used by practitioners. Biological Conservation, 235: 93-101. doi: 10.1016/j.biocon.2019.04.011
Boch, S.; Bedolla, A.; Ecker, K.T.; Graf, U.; Küchler, H.; Küchler, M.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2019: Mean indicator values suggest decreasing habitat quality in Swiss dry grasslands and are robust to relocation error. Tuexenia, 39: 315-334. doi: 10.14471/2019.39.010
Dähler, N.B.; Holderegger, R.; INFO FLORA; Bergamini, A., 2019: Effectiveness of Swiss protected areas in maintaining populations of rare vascular plants. Journal for Nature Conservation, 52: 125749 (6 pp.). doi: 10.1016/j.jnc.2019.125749
Ortiz‐Rodríguez, D.O.; Guisan, A.; Holderegger, R.; Van Strien, M.J., 2019: Predicting species occurrences with habitat network models. Ecology and Evolution, 9, 18: 10457-10471. doi: 10.1002/ece3.5567
Holderegger, R.; Balkenhol, N.; Bolliger, J.; Engler, J.O.; Gugerli, F.; Hochkirch, A.; Nowak, C.; Segelbacher, G.; Widmer, A.; Zachos, F.E., 2019: Conservation genetics: linking science with practice. Molecular Ecology, 28, 17: 3848-3856. doi: 10.1111/mec.15202
Boch, S.; Bedolla, A.; Ecker, K.T.; Ginzler, C.; Graf, U.; Küchler, H.; Küchler, M.; Nobis, M.P.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2019: Threatened and specialist species suffer from increased wood cover and productivity in Swiss steppes. Flora, 258: 151444 (9 pp.). doi: 10.1016/j.flora.2019.151444
Milanesi, P.; Caniglia, R.; Fabbri, E.; Puopolo, F.; Galaverni, M.; Holderegger, R., 2018: Combining Bayesian genetic clustering and ecological niche modeling: insights into wolf intraspecific genetic structure. Ecology and Evolution, 8, 22: 11224-11234. doi: 10.1002/ece3.4594
Büttner, M.; Holderegger, R., 2018: Schaffhausens emblematische Art Potentilla micrantha DC. – ihre Verbreitung 1915, 1943 und 2017. Bauhinia, 27: 23-31.
DiLeo, M.F.; Holderegger, R.; Wagner, H.H., 2018: Contemporary pollen flow as a multiscale process: evidence from the insect‐pollinated herb, Pulsatilla vulgaris. Journal of Ecology, 106, 6: 2242-2255. doi: 10.1111/1365-2745.12992
Halbritter, A.H.; Fior, S.; Keller, I.; Billeter, R.; Edwards, P.J.; Holderegger, R.; Karrenberg, S.; Pluess, A.R.; Widmer, A.; Alexander, J.M., 2018: Trait differentiation and adaptation of plants along elevation gradients. Journal of Evolutionary Biology, 31, 6: 784-800. doi: 10.1111/jeb.13262
Rogivue, A.; Graf, R.; Parisod, C.; Holderegger, R.; Gugerli, F., 2018: The phylogeographic structure of Arabis alpina in the Alps shows consistent patterns across different types of molecular markers and geographic scales. Alpine Botany, 128, 1: 35-45. doi: 10.1007/s00035-017-0196-8
Richner, N.; Walter, T.; Linder, H.P.; Holderegger, R., 2018: Arable weed seed bank of grassland on former arable fields in mountain regions. Folia Geobotanica, 53, 1: 49-61. doi: 10.1007/s12224-017-9288-x
Klaiber, J.; Bergamini, A.; Holderegger, R., 2017: Fauna Indicativa – ein neues Werkzeug für die ökologische Auswertung faunistischer Daten der Schweiz. Präferenzen von Libellen, Heuschrecken, Laufkäfern und Tagfaltern. Naturschutz und Landschaftsplanung, 49, 12: 392-397.
Rellstab, C.; Fischer, M.C.; Csencsics, D.; Gugerli, F.; Holderegger, R., 2017: Bedeutung der lokalen Anpassung in der Naturschutzgenetik. In: Csencsics, D.; Gugerli, F. (eds), 2017: Naturschutzgenetik. Forum für Wissen 2017, WSL Birmensdorf. 31-37.
Holderegger, R., 2017: Genetik im Naturschutz: eine Übersicht. In: Csencsics, D.; Gugerli, F. (eds), 2017: Naturschutzgenetik. Forum für Wissen 2017, WSL Birmensdorf. 7-13.
Fischer, M.C.; Rellstab, C.; Leuzinger, M.; Roumet, M.; Gugerli, F.; Shimizu, K.K.; Holderegger, R.; Widmer, A., 2017: Estimating genomic diversity and population differentiation – an empirical comparison of microsatellite and SNP variation in Arabidopsis halleri. BMC Genomics, 18: 69 (15 pp.). doi: 10.1186/s12864-016-3459-7
Richner, N.; Holderegger, R.; Linder, H.P.; Walter, T., 2017: Dramatic decline in the Swiss arable flora since the 1920s. Agriculture, Ecosystems and Environment, 241: 179-192. doi: 10.1016/j.agee.2017.03.016
Milanesi, P.; Holderegger, R.; Caniglia, R.; Fabbri, E.; Galaverni, M.; Randi, E., 2017: Expert-based versus habitat-suitability models to develop resistance surfaces in landscape genetics. Oecologia, 183, 1: 67-79. doi: 10.1007/s00442-016-3751-x
Milanesi, P.; Breiner, F.T.; Puopolo, F.; Holderegger, R., 2017: European human-dominated landscapes provide ample space for the recolonization of large carnivore populations under future land change scenarios. Ecography, 40, 12: 1359-1368. doi: 10.1111/ecog.02223
Milanesi, P.; Holderegger, R.; Bollmann, K.; Gugerli, F.; Zellweger, F., 2017: Three-dimensional habitat structure and landscape genetics: a step forward in estimating functional connectivity. Ecology, 98, 2: 393-402. doi: 10.1002/ecy.1645
Rellstab, C.; Fischer, M.C.; Zoller, S.; Graf, R.; Tedder, A.; Shimizu, K.K.; Widmer, A.; Holderegger, R.; Gugerli, F., 2017: Local adaptation (mostly) remains local: reassessing environmental associations of climate-related candidate SNPs in Arabidopsis halleri. Heredity, 118, 2: 193-201. doi: 10.1038/hdy.2016.82
Holderegger, R., 2016: Vielfältige Anwendungen genetischer Methoden im Wald. Schweizerische Zeitschrift für Forstwesen, 167, 6: 308-315. doi: 10.3188/szf.2016.0308
Milanesi, P.; Holderegger, R.; Caniglia, R.; Fabbri, E.; Randi, E., 2016: Different habitat suitability models yield different least-cost path distances for landscape genetic analysis. Basic and Applied Ecology, 17, 1: 61-71. doi: 10.1016/j.baae.2015.08.008
Csencsics, D.; Holderegger, R., 2016: Origin of natural regeneration of black poplar (Populus nigra L.) and co-occurrence with hybrid poplar offspring. Flora, 222: 20-26. doi: 10.1016/j.flora.2016.03.009
DiLeo, M.F.; Graf, R.; Holderegger, R.; Rico, Y.; Wagner, H.H., 2015: Highly polymorphic microsatellite markers in Pulsatilla vulgaris (Ranunculaceae) using next-generation sequencing. Applications in Plant Sciences, 3, 7: 1500031 (3 pp.). doi: 10.3732/apps.1500031
Tschopp, T.; Holderegger, R.; Bollmann, K., 2015: Auswirkungen der Douglasie auf die Waldbiodiversität. Schweizerische Zeitschrift für Forstwesen, 166, 1: 9-15. doi: 10.3188/szf.2015.0009
Van Strien, M.J.; Holderegger, R.; Van Heck, H.J., 2015: Isolation-by-distance in landscapes: considerations for landscape genetics. Heredity, 114, 1: 27-37. doi: 10.1038/hdy.2014.62
Richner, N.; Holderegger, R.; Linder, H.P.; Walter, T., 2015: Reviewing change in the arable flora of Europe: a meta-analysis. Weed Research, 55, 1: 1-13. doi: 10.1111/wre.12123
Rellstab, C.; Gugerli, F.; Eckert, A.J.; Hancock, A.M.; Holderegger, R., 2015: A practical guide to environmental association analysis in landscape genomics. Molecular Ecology, 24, 17: 4348-4370. doi: 10.1111/mec.13322
Le Lay, G.; Angelone, S.; Holderegger, R.; Flory, C.; Bolliger, J., 2015: Increasing pond density to maintain a patchy habitat network of the European Treefrog (Hyla arborea). Journal of Herpetology, 49, 2: 217-221. doi: 10.1670/13-056
Keller, D.; Holderegger, R.; Van Strien, M.J.; Bolliger, J., 2015: How to make landscape genetics beneficial for conservation management?. Conservation Genetics, 16, 3: 503-512. doi: 10.1007/s10592-014-0684-y
Aavik, T.; Holderegger, R.; Bolliger, J., 2014: The structural and functional connectivity of the grassland plant Lychnis flos-cuculi. Heredity, 112, 5: 471-478. doi: 10.1038/hdy.2013.120
Keller, I.; Alexander, J.M.; Edwards, P.J.; Holderegger, R., 2014: Lokale Anpassungen an verschiedene Höhenlagen. Natur und Landschaft, 89, 4: 145-150. doi: 10.17433/4.2014.50153265.145-150
Buehler, D.; Holderegger, R.; Brodbeck, S.; Schnyder, E.; Gugerli, F., 2014: Validation of outlier loci through replication in independent data sets: a test on Arabis alpina. Ecology and Evolution, 4, 22: 4296-4306. doi: 10.1002/ece3.1300
Mazenauer, D.; Holderegger, R.; Krüsi, B.; Hepenstrick, D., 2014: Populationsentwicklung und Gefährdung von Asplenium septentrionale auf Findlingen im Schweizer Mittelland und Jura. Bauhinia, 25: 37-50.
Van Strien, M.J.; Keller, D.; Holderegger, R.; Ghazoul, J.; Kienast, F.; Bolliger, J., 2014: Landscape genetics as a tool for conservation planning: predicting the effects of landscape change on gene flow. Ecological Applications, 24, 2: 327-339. doi: 10.1890/13-0442.1
Rico, Y.; Holderegger, R.; Boehmer, H.J.; Wagner, H.H., 2014: Directed dispersal by rotational shepherding supports landscape genetic connectivity in a calcareous grassland plant. Molecular Ecology, 23, 4: 832-842. doi: 10.1111/mec.12639
Aavik, T.; Bosshard, D.; Edwards, P.J.; Holderegger, R.; Billeter, R., 2014: Fitness in naturally occurring and restored populations of a grassland plant lychnis flos-cuculiy in a Swiss agricultural landscape. Restoration Ecology, 22, 1: 98-106. doi: 10.1111/rec.12020
Buehler, D.; Poncet, B.N.; Holderegger, R.; Manel, S.; Taberlet, P.; Gugerli, F., 2013: An outlier locus relevant in habitat-mediated selection in an alpine plant across independent regional replicates. Evolutionary Ecology, 27, 2: 285-300. doi: 10.1007/s10682-012-9597-8
Seymour, M.; Räsänen, K.; Holderegger, R.; Kristjánsson, B.K., 2013: Connectivity in a pond system influences migration and genetic structure in threespine stickleback. Ecology and Evolution, 3, 3: 492-502. doi: 10.1002/ece3.476
Fischer, M.C.; Rellstab, C.; Tedder, A.; Zoller, S.; Gugerli, F.; Shimizu, K.K.; Holderegger, R.; Widmer, A., 2013: Population genomic footprints of selection and associations with climate in natural populations of Arabidopsis halleri from the Alps. Molecular Ecology, 22, 22: 5594-5607. doi: 10.1111/mec.12521
Walzer, C.; Kowalczyk, C.; Alexander, J.M.; Baur, B.; Bogliani, G.; Brun, J.; Füreder, L.; Guth, M.; Haller, R.; Holderegger, R.; Kohler, Y.; Kueffer, C.; Righetti, A.; Spaar, R.; Sutherland, W.J.; Ullrich-Schneider, A.; Vanpeene-Bruhier, S.N.; Scheurer, T., 2013: The 50 most important questions relating to the maintenance and restoration of an ecological continuum in the European Alps. PLoS One, 8, 1: e53139 (11 pp.). doi: 10.1371/journal.pone.0053139
Winkler, M.; Tribsch, A.; Schneeweiss, G.M.; Brodbeck, S.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Schönswetter, P., 2013: Strong nuclear differentiation contrasts with widespread sharing of plastid DNA haplotypes across taxa in European purple saxifrages (Saxifraga section Porphyrion subsection Oppositifoliae). Botanical Journal of the Linnean Society, 173, 4: 622-636. doi: 10.1111/boj.12104
Manel, S.; Holderegger, R., 2013: Ten years of landscape genetics. Trends in Ecology and Evolution, 28, 10: 614-621. doi: 10.1016/j.tree.2013.05.012
Keller, I.; Alexander, J.M.; Holderegger, R.; Edwards, P.J., 2013: Widespread phenotypic and genetic divergence along altitudinal gradients in animals. Journal of Evolutionary Biology, 26, 12: 2527-2543. doi: 10.1111/jeb.12255
Keller, D.; Holderegger, R.; Van Strien, M.J., 2013: Spatial scale affects landscape genetic analysis of a wetland grasshopper. Molecular Ecology, 22, 9: 2467-2482. doi: 10.1111/mec.12265
Keller, D.; Van Strien, M.J.; Herrmann, M.; Bolliger, J.; Edwards, P.J.; Ghazoul, J.; Holderegger, R., 2013: Is functional connectivity in common grasshopper species affected by fragmentation in an agricultural landscape?. Agriculture, Ecosystems and Environment, 175: 39-46. doi: 10.1016/j.agee.2013.05.006
Keller, D.; Holderegger, R., 2013: Damselflies use different movement strategies for short- and long-distance dispersal. Insect Conservation and Diversity, 6, 5: 590-597. doi: 10.1111/icad.12016
Herrmann, M.; Holderegger, R.; Van Strien, M.J., 2013: Influence of parameter settings in automated scoring of AFLPs on population genetic analysis. Molecular Ecology Resources, 13, 1: 128-134. doi: 10.1111/1755-0998.12033
Bothwell, H.; Bisbing, S.; Therkildsen, N.O.; Crawford, L.; Alvarez, N.; Holderegger, R.; Manel, S., 2013: Identifying genetic signatures of selection in a non-model species, alpine gentian (Gentiana nivalis L.), using a landscape genetic approach. Conservation Genetics, 14, 2: 467-481. doi: 10.1007/s10592-012-0411-5
Aavik, T.; Holderegger, R.; Edwards, P.J.; Billeter, R., 2013: Patterns of contemporary gene flow suggest low functional connectivity of grasslands in a fragmented agricultural landscape. Journal of Applied Ecology, 50, 2: 395-403. doi: 10.1111/1365-2664.12053
Keller, D.; Seidl, I.; Forrer, C.; Home, R.; Holderegger, R., 2013: Schutz der Helm-Azurjungfer Coenagrion mercuriale (Odonata: Coenagrionidae) am Beispiel des Smaragd-Gebiets Oberaargau. Entomo Helvetica, 6: 87-99.
Peintinger, M.; Arrigo, N.; Brodbeck, S.; Koller, A.; Imsand, M.; Holderegger, R., 2012: Genetic differentiation of the endemic grass species Deschampsia littoralis at pre-Alpine lakes. Alpine Botany, 122, 2: 87-93. doi: 10.1007/s00035-012-0107-y
Taberlet, P.; Zimmermann, N.E.; Englisch, T.; Tribsch, A.; Holderegger, R.; Alvarez, N.; Niklfeld, H.; Coldea, G.; Mirek, Z.; Moilanen, A.; Steinmann, K.; Thiel-Egenter, C.; Wohlgemuth, T.; Gugerli, F.; IntraBioDiv Consortium, 2012: Genetic diversity in widespread species is not congruent with species richness in alpine plant communities. Ecology Letters, 15, 12: 1439-1448. doi: 10.1111/ele.12004
Buehler, D.; Graf, R.; Holderegger, R.; Gugerli, F., 2012: Contemporary gene flow and mating system of Arabis alpina in a Central European alpine landscape. Annals of Botany, 109, 7: 1359-1367. doi: 10.1093/aob/mcs066
Manel, S.; Gugerli, F.; Thuiller, W.; Alvarez, N.; Legendre, P.; Holderegger, R.; Gielly, L.; Taberlet, P.; IntraBioDiv Consortium, 2012: Broad-scale adaptive genetic variation in alpine plants is driven by temperature and precipitation. Molecular Ecology, 21, 15: 3729-3738. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05656.x
Hoebee, S.E.; Angelone, S.; Csencsics, D.; Määttänen, K.; Holderegger, R., 2012: Diversity of S-alleles and mate availability in 3 populations of self-incompatible wild pear (Pyrus pyraster). Journal of Heredity, 103, 2: 260-267. doi: 10.1093/jhered/esr126
Wagner, H.H.; Murphy, M.A.; Holderegger, R.; Waits, L., 2012: Developing an interdisciplinary, distributed graduate course for twenty-first century scientists. BioScience, 62, 2: 182-188. doi: 10.1525/bio.2012.62.2.11
Keller, D.; Jung, E.; Holderegger, R., 2012: Development of microsatellite markers for the wetland grasshopper Stethophyma grossum. Conservation Genetics Resources, 4, 2: 507-509. doi: 10.1007/s12686-011-9586-1
Kamm, U.; Gugerli, F.; Rotach, P.; Edwards, P.; Holderegger, R., 2012: Seltenes und zerstreutes Vorkommen: Auswirkungen auf den Paarungserfolg des Speierlings. Schweizerische Zeitschrift für Forstwesen, 163, 4: 130-136. doi: 10.3188/szf.2012/0130
Hepenstrick, D.; Holderegger, R.; Keller, D., 2012: Monitoring von Populationen der Helm-Azurjungfer Coenagrion mercuriale (Odonata: Coenagrionidae): Was taugen zwei Begehungen pro Saison?. Entomo Helvetica, 5: 139-145.
Van Strien, M.J.; Keller, D.; Holderegger, R., 2012: A new analytical approach to landscape genetic modelling: least-cost transect analysis and linear mixed models. Molecular Ecology, 21, 16: 4010-4023. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05687.x
Winkler, M.; Tribsch, A.; Schneeweiss, G.M.; Brodbeck, S.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Abbotts, R.J.; Schönswetter, P., 2012: Tales of the unexpected: phylogeography of the arctic-alpine model plant Saxifraga oppositifolia (Saxifragaceae) revisited. Molecular Ecology, 21, 18: 4618-4630. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05705.x
Parisod, C.; Holderegger, R., 2012: Meeting review. Adaptive landscape genetics: pitfalls and benefits. Molecular Ecology, 21, 15: 3644-3646. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05675.x
Landergott, U.; Gugerli, F.; Hoebee, S.E.; Finkeldey, R.; Holderegger, R., 2012: Effects of seed mass on seedling height and competition in European white oaks. Flora, 207, 10: 721-725. doi: 10.1016/j.flora.2012.09.001
Kueffer, C.; Underwood, E.; Hirsch Hadorn, G.; Holderegger, R.; Lehning, M.; Pohl, C.; Schirmer, M.; Schwarzenbach, R.; Stauffacher, M.; Wuelser, G.; Edwards, P., 2012: Enabling effective problem-oriented research for sustainable development. Ecology and Society, 17, 4: 8 (16 pp.). doi: 10.5751/Es-05045-170408
Keller, D.; Van Strien, M.J.; Holderegger, R., 2012: Do landscape barriers affect functional connectivity of populations of an endangered damselfly?. Freshwater Biology, 57, 7: 1373-1384. doi: 10.1111/j.1365-2427.2012.02797.x
Jay, F.; Manel, S.; Alvarez, N.; Durand, E.Y.; Thuiller, W.; Holderegger, R.; Taberlet, P.; François, O., 2012: Forecasting changes in population genetic structure of alpine plants in response to global warming. Molecular Ecology, 21, 10: 2354-2368. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05541.x
Holderegger, R.; Gugerli, F., 2012: Where do you come from, where do you go? Directional migration rates in landscape genetics. Molecular Ecology, 21, 23: 5640-5642. doi: 10.1111/mec.12032
Hepenstrick, D.; Thiel, D.; Holderegger, R.; Gugerli, F., 2012: Genetic discontinuities in roe deer (Capreolus capreolus) coincide with fenced transportation infrastructure. Basic and Applied Ecology, 13, 7: 631-638. doi: 10.1016/j.baae.2012.08.009
Diacon-Bolli, J.; Dalang, T.; Holderegger, R.; Bürgi, M., 2012: Heterogeneity fosters biodiversity: linking history and ecology of dry calcareous grasslands. Basic and Applied Ecology, 13, 8: 641-653. doi: 10.1016/j.baae.2012.10.004
Aavik, T.; Edwards, P.J.; Holderegger, R.; Graf, R.; Billeter, R., 2012: Genetic consequences of using seed mixtures in restoration: a case study of a wetland plant Lychnis flos-cuculi. Biological Conservation, 145, 1: 195-204. doi: 10.1016/j.biocon.2011.11.004
Widmer, I.; Dal Grande, F.; Excoffier, L.; Holderegger, R.; Keller, C.; Mikryukov, V.S.; Scheidegger, C., 2012: European phylogeography of the epiphytic lichen fungus Lobaria pulmonaria and its green algal symbiont. Molecular Ecology, 21, 23: 5827-5844. doi: 10.1111/mec.12051
Bolliger, J.; Keller, D.; Holderegger, R., 2011: When landscape variables do not explain migration rates: an example from an endangered dragonfly, Leucorrhinia caudalis (Odonata: Libellulidae). European Journal of Entomology, 108, 2: 327-330. doi: 10.14411/eje.2011.039
Holderegger, R.; Thiel-Egenter, C.; Parisod, C., 2011: Marie Brockmann-Jerosch and her influence on Alpine phylogeography. Alpine Botany, 121, 1: 5-10. doi: 10.1007/s00035-010-0086-9
Waser, N.M.; Wirth, L.R.; Graf, R.; Gugerli, F.; Landergott, U.; Erhardt, A.; Linder, H.P.; Holderegger, R., 2011: Effects of floral neighborhood on seed set and degree of outbreeding in a high-alpine cushion plant. Oecologia, 167, 2: 427-434. doi: 10.1007/s00442-011-1985-1
Thiel-Egenter, C.; Alvarez, N.; Holderegger, R.; Tribsch, A.; Englisch, T.; Wohlgemuth, T.; Colli, L.; Gaudeul, M.; Gielly, L.; Jogan, N.; Linder, H.P.; Negrini, R.; Niklfeld, H.; Pellecchia, M.; Rioux, D.; Schönswetter, P.; Taberlet, P.; Van Loo, M.; Winkler, M.; ... Gugerli, F., 2011: Break zones in the distributions of alleles and species in alpine plants. Journal of Biogeography, 38, 4: 772-782. doi: 10.1111/j.1365-2699.2010.02441.x
Sieber, Y.; Holderegger, R.; Waser, N.M.; Thomas, V.F.D.; Braun, S.; Erhardt, A.; Reyer, H.; Wirth, L.R., 2011: Do alpine plants facilitate each other's pollination? Experiments at a small spatial scale. Acta Oecologica, 37, 4: 369-374. doi: 10.1016/j.actao.2011.04.005
Kamm, U.; Gugerli, F.; Rotach, P.; Edwards, P.; Holderegger, R., 2011: Genetic consequences of low local tree densities - implications for the management of naturally rare, insect pollinated species in temperate forests. Forest Ecology and Management, 262, 6: 1047-1053. doi: 10.1016/j.foreco.2011.05.040
Angelone, S.; Kienast, F.; Holderegger, R., 2011: Where movement happens: scale-dependent landscape effects on genetic differentiation in the European tree frog. Ecography, 34, 5: 714-722. doi: 10.1111/j.1600-0587.2010.06494.x
Keller, D.; Brodbeck, S.; Flöss, I.; Vonwil, G.; Holderegger, R., 2011: Ausbreitung und Besiedlungsgeschichte der Zierlichen Moosjungfer Leucorrhinia caudalis in der Schweiz (Odonata: Libellulidae). Entomo Helvetica, 4: 139-152.
Buehler, D.; Graf, R.; Holderegger, R.; Gugerli, F., 2011: Using the 454 pyrosequencing-based technique in the development of nuclear microsatellite loci in the alpine plant Arabis alpina (Brassicaceae). American Journal of Botany, 98, 5: e103-e105. doi: 10.3732/ajb.1000488
Jimenez, A.; Holderegger, R.; Csencsics, D.; Quintanilla, L.G., 2010: Microsatellites reveal substantial among-population genetic differentiation and strong inbreeding in the relict fern Dryopteris aemula. Annals of Botany, 106, 1: 149-155. doi: 10.1093/aob/mcq094
Manel, S.; Poncet, B.N.; Legendre, P.; Gugerli, F.; Holderegger, R., 2010: Common factors drive adaptive genetic variation at different spatial sclaes in Arabis alpina. Molecular Ecology, 19, 17: 3824-3835. doi: 10.1111/j.1365-294X.2010.04716.x
Wirth, L.R.; Graf, R.; Gugerli, F.; Landergott, U.; Holderegger, R., 2010: Between-year variation in seed weights across altitudes in the high-alpine plant Eritrichium nanum. Plant Ecology, 207, 2: 227-231. doi: 10.1007/s11258-009-9667-3
Kamm, U.; Gugerli, F.; Rotach, P.; Edwards, P.; Holderegger, R., 2010: Open areas in a landscape enhance pollen-mediated gene flow of a tree species: evidence from northern Switzerland. Landscape Ecology, 25, 6: 903-911. doi: 10.1007/s10980-010-9468-z
Csencsics, D.; Brodbeck, S.; Holderegger, R., 2010: Cost-effective, species-specific microsatellite development for the endangered dwarf bulrush (Typha minima) using next-generation sequencing technology. Journal of Heredity, 101, 6: 789-793. doi: 10.1093/jhered/esq069
Wirth, L.; Graf, R.; Gugerli, F.; Landergott, U.; Holderegger, R., 2010: Lower selfing rate at higher altitudes in the alpine plant Eritrichium nanum (Boraginaceae). American Journal of Botany, 97, 5: 899-901. doi: 10.3732/ajb.0900297
Storfer, A.; Murphy, M.a.; Spear, S.F.; Holderegger, R.; Waits, L.P., 2010: Landscape genetics: where are we now?. Molecular Ecology, 19, 17: 3496-3514. doi: 10.1111/j.1365-294X.2010.04691.x
Segelbacher, G.; Cushman, S.A.; Epperson, B.K.; Fortin, M.; Francois, O.; Hardy, O.J.; Holderegger, R.; Taberlet, P.; Waits, L.P.; Manel, S., 2010: Applications of landscape genetics in conservation biology: concepts and challenges. Conservation Genetics, 11, 2: 375-385. doi: 10.1007/s10592-009-0044-5
Poncet, B.N.; Herrmann, D.; Gugerli, F.; Taberlet, P.; Holderegger, R.; Gielly, L.; Rioux, D.; Thuiller, W.; Aubert, S.; Manel, S., 2010: Tracking genes of ecological relevance using a genome scan in two independent regional population samples of Arabis alpina. Molecular Ecology, 19, 14: 2896-2907. doi: 10.1111/j.1365-294X.2010.04696.x
Parisod, C.; Holderegger, R.; Brochmann, C., 2010: Evolutionary consequences of autopolyploidy. New Phytologist, 186, 1: 5-17. doi: 10.1111/j.1469-8137.2009.03142.x
Manel, S.; Joost, S.; Epperson, B.K.; Holderegger, R.; Storfer, A.; Rosenberg, M.S.; Scribner, K.T.; Bonin, A.; Fortin, M., 2010: Perspectives on the use of landscape genetics to detect genetic adaptive variation in the field. Molecular Ecology, 19, 17: 3760-3772. doi: 10.1111/j.1365-294X.2010.04717.x
Anderson, C.D.; Epperson, B.K.; Fortin, M.; Holderegger, R.; James, P.M.A.; Rosenberg, M.S.; Scribner, K.T.; Spear, S., 2010: Considering spatial and temporal scale in landscape-genetic studies of gene flow. Molecular Ecology, 19, 17: 3565-3575. doi: 10.1111/j.1365-294X.2010.04757.x
Holderegger, R.; Di Giulio, M., 2010: The genetic effects of roads: a review of empirical evidence. Basic and Applied Ecology, 11, 6: 522-531. doi: 10.1016/j.baae.2010.06.006
Keller, D.; Brodbeck, S.; Flöss, I.; Vonwil, G.; Holderegger, R., 2010: Ecological and genetic measurements of dispersal in a threatened dragonfly. Biological Conservation, 143, 11: 2658-2663. doi: 10.1016/j.biocon.2010.07.008
Bolliger, J.; Le Lay, G.; Holderegger, R., 2010: Landscape genetics. How landscapes affect ecological processes. GAIA: Ecological Perspectives for Science and Society, 19, 3: 238-240. doi: 10.14512/gaia.19.3.19
Holderegger, R.; Buehler, D.; Gugerli, F.; Manel, S., 2010: Landscape genetics of plants. Trends in Plant Science, 15, 12: 675-683. doi: 10.1016/j.tplants.2010.09.002
Balkenhol, N.; Gugerli, F.; Cushman, S.A.; Waits, L.P.; Coulon, A.; Arntzen, J.W.; Holderegger, R.; Wagner, H.H., 2009: Identifying future research needs in landscape genetics: where to from here?. Landscape Ecology, 24: 455-463. doi: 10.1007/s10980-009-9334-z
Landergott, U.; Schneller, J.J.; Holderegger, R.; Thompson, J.D., 2009: Sex-ratio variation and spatial distribution of nuclear and cytoplasmic sex-determining genes in gynodioecious Thymus praecox across altitudinal gradients. Evolutionary Ecology Research, 11: 23-42.
Keller, D.; Brodbeck, S.; Holderegger, R., 2009: Characterization of microsatellite loci in Leucorrhinia caudalis, a rare dragonfly endangered throughout Europe. Conservation Genetics Resources, 1, 1: 179-181. doi: 10.1007/s12686-009-9044-5
Wirth, L.R.; Graf, R.; Brodbeck, S.; Reber-Funk, C.; Holderegger, R.; Landergott, U., 2009: Fully informative microsatellite markers for the tetraploid plant Eritrichium nanum (Boraginaceae). Molecular Ecology Resources, 9, 1: 312-314. doi: 10.1111/j.1755-0998.2008.02449.x
Thiel-Egenter, C.; Gugerli, F.; Alvarez, N.; Brodbeck, S.; Cieslak, E.; Colli, L.; Englisch, T.; Gaudeul, M.; Gielly, L.; Korbecka, G.; Negrini, R.; Paun, O.; Pellecchia, M.; Rioux, D.; Ronikier, M.; Schönswetter, P.; Schüpfer, F.; Taberlet, P.; Tribsch, A.; ... IntraBioDiv Consortium, 2009: Effects of species traits on the genetic diversity of high-mountain plants: a multi-species study across the Alps and the Carpathians. Global Ecology and Biogeography, 18, 1: 78-87. doi: 10.1111/j.1466-8238.2008.00421.x
Thiel-Egenter, C.; Holderegger, R.; Brodbeck, S.; IntraBioDiv Consortium; Gugerli, F., 2009: Concordant genetic breaks, identified by combining clustering and tessellation methods, in two co-distributed alpine plant species. Molecular Ecology, 18, 21: 4495-4507. doi: 10.1111/j.1365-294X.2009.04360.x
Kamm, U.; Rotach, P.; Gugerli, F.; Siroky, M.; Edwards, P.; Holderegger, R., 2009: Frequent long-distance gene flow in a rare temperate forest tree (Sorbus domestica) at the landscape scale. Heredity, 103, 6: 476-482. doi: 10.1038/hdy.2009.70
Holderegger, R.; Thiel-Egenter, C., 2009: A discussion of different types of glacial refugia used in mountain biogeography and phylogeography. Journal of Biogeography, 36, 3: 476-480. doi: 10.1111/j.1365-2699.2008.02027.x
Angelone, S.; Holderegger, R., 2009: Population genetics suggests effectiveness of habitat connectivity measures for the European tree frog in Switzerland. Journal of Applied Ecology, 46, 4: 879-887. doi: 10.1111/j.1365-2664.2009.01670.x
Alvarez, N.; Thiel-Egenter, C.; Tribsch, A.; Holderegger, R.; Manel, S.; Schönswetter, P.; Taberlet, P.; Brodbeck, S.; Gaudeul, M.; Gielly, L.; Küpfer, P.; Mansion, G.; Negrini, R.; Paun, O.; Pellecchia, M.; Rioux, D.; Schüpfer, F.; Van Loo, M.; Winkler, M.; ... IntraBioDiv Consortium, 2009: History or ecology? Substrate types as a major driver of spatial genetic structure in Alpine plants. Ecology Letters, 12, 7: 632-640. doi: 10.1111/j.1461-0248.2009.01312.x
Di Giulio, M.; Holderegger, R.; Tobias, S., 2009: Effects of habitat and landscape fragmentation on humans and biodiversity in densely populated landscapes. Journal of Environmental Management, 90, 10: 2959-2968. doi: 10.1016/j.jenvman.2009.05.002
Csencsics, D.; Angelone, S.; Paniga, M.; Rotach, P.; Rudow, A.; Sabiote, E.; Schwab, P.; Wohlhauser, P.; Holderegger, R., 2009: A large scale survey of Populus nigra presence and genetic introgression from non-native poplars in Switzerland based on molecular identification. Journal for Nature Conservation, 17, 3: 142-149. doi: 10.1016/j.jnc.2009.01.004
Gugerli, F.; Brodbeck, S.; Holderegger, R., 2008: Utility of multilocus genotypes for taxon assignment in stands of closely related European white oaks from Switzerland. Annals of Botany, 102, 5: 855-863. doi: 10.1093/aob/mcn164
Holderegger, R.; Wagner, H.H., 2008: Landscape genetics. BioScience, 58, 3: 199-207. doi: 10.1641/B580306
Gugerli, F.; Brodbeck, S.; Holderegger, R., 2008: Insertions-deletions in a microsatellite flanking region may be resolved by variation in stuttering patterns. Plant Molecular Biology Reporter, 26, 3: 255-262. doi: 10.1007/s11105-008-0034-7
Raffl, C.; Holderegger, R.; Parson, W.; Erschbamer, B., 2008: Patterns in genetic diversity of Trifolium pallescens populations do not reflect chronosequence on alpine glacier forelands. Heredity, 100, 5: 526-532. doi: 10.1038/hdy.2008.8
Määttänen, K.; Holderegger, R., 2008: Populationsgeschichte und Managementprinzipien in Schweizer Wildbirnenvorkommen. Schweizerische Zeitschrift für Forstwesen, 159, 1: 8-16. doi: 10.3188/szf.2008.0008
Holderegger, R.; Herrmann, D.; Poncet, B.; Gugerli, F.; Thuiller, W.; Taberlet, P.; Gielly, L.; Rioux, D.; Brodbeck, S.; Aubert, S.; Manel, S., 2008: Land ahead: using genome scans to identify molecular markers of adaptive relevance. Plant Ecology and Diversity, 1, 2: 273-283. doi: 10.1080/17550870802338420
Holderegger, R.; Häner, R.; Csencsics, D.; Angelone, S.; Hoebee, S.E., 2008: S-allele diversity suggests no mate limitation in small populations of a self-incompatible plant. Evolution, International Journal of Organic Evolution, 62, 11: 2922-2928. doi: 10.1111/j.1558-5646.2008.00498.x
Gugerli, F.; Englisch, T.; Niklfeld, H.; Tribsch, A.; Mirek, Z.; Ronikier, M.; Zimmermann, N.E.; Holderegger, R.; Taberlet, P.; IntraBioDiv Consortium, 2008: Relationships among levels of biodiversity and the relevance of intraspecific diversity in conservation - a project synopsis. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 10, 4: 259-281. doi: 10.1016/j.ppees.2008.07.001
Dietschi, S.; Holderegger, R.; Gehrig Schmidt, S.; Linder, P., 2007: Agri-environment incentive payments and plant species richness under different management intensities in mountain meadows of Switzerland. Acta Oecologica, 31, 2: 216-222. doi: 10.1016/j.actao.2006.10.006
Gugerli, F.; Walser, J.-C.; Dounavi, K.; Holderegger, R.; Finkeldey, R., 2007: Coincidence of small-scale spatial discontinuities in leaf morphology and nuclear microsatellite variation of Quercus petraea and Q. robur in a mixed forest. Annals of Botany, 99, 4: 713-722. doi: 10.1093/aob/mcm006
Stehlik, I.; Caspersen, J.P.; Wirth, L.; Holderegger, R., 2007: Floral free fall in the Swiss Lowlands: environmental determinants of local plant extinction in a peri-urban landscape. Journal of Ecology, 95, 4: 734-744. doi: 10.1111/j.1365-2745.2007.01246.x
Werth, S.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Wagner, H.H.; Csencsics, D.; Scheidegger, C., 2007: Landscape-level gene flow in Lobaria pulmonaria, an epiphytic lichen. Molecular Ecology, 16, 13: 2807-2815. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03344.x
Hoebee, S.E.; Arnold, U.; Düggelin, C.; Gugerli, F.; Brodbeck, S.; Rotach, P.; Holderegger, R., 2007: Mating patterns and contemporary gene flow by pollen in a large continuous and a small isolated population of the scattered forest tree Sorbus torminalis. Heredity, 99, 1: 47-55. doi: 10.1038/sj.hdy.6800962
Angelone, S.; Hilfiker, K.; Holderegger, R.; Bergamini, A.; Hoebee, S.E., 2007: Regional population dynamics define the local genetic structure in Sorbus torminalis. Molecular Ecology, 16: 1291-1301. doi: 10.1111/j.0962-1083.2006.03202.x
Bettin, O.; Cornejo, C.; Edwards, P.J.; Holderegger, R., 2007: Phylogeography of the high alpine plant Senecio halleri (Asteraceae) in the European Alps: in situ glacial survival with postglacial stepwise dispersal into peripheral areas. Molecular Ecology, 16, 12: 2517-2524. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03273.x
Hoebee, S.E.; Menn, C.; Rotach, P.; Finkeldey, R.; Holderegger, R., 2006: Spatial genetic structure of Sorbus torminalis: the extent of clonal reproduction in natural stands of a rare tree species with a scattered distribution. Forest Ecology and Management, 226, 1-3: 1-8. doi: 10.1016/j.foreco.2005.12.024
Landergott, U.; Naciri, Y.; Schneller, J.J.; Holderegger, R., 2006: Allelic configuration and polysomic inheritance of highly variable microsatellites in tetraploid gynodiaecious Thymus praecox agg.. Theoretical and Applied Genetics, 113, 3: 453-465. doi: 10.1007/s00122-006-0310-6
Wirth, L.R.; Schneller, J.; Holderegger, R., 2006: Une clé de détermination simplifiée des fougères de Suisse. Saussurea: Journal de la Société Botanique de Genève, 36: 61-72.
Werth, S.; Wagner, H.H.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Csencsics, D.; Kalwij, J.M.; Scheidegger, C., 2006: Quantifying dispersal and establishment limitation in a population of an epiphytic lichen. Ecology, 87, 8: 2037-2046. doi: 10.1890/0012-9658(2006)87[2037:QDAELI]2.0.CO;2
Werth, S.; Wagner, H.H.; Holderegger, R.; Kalwij, J.M.; Scheidegger, C., 2006: Effect of disturbances on the genetic diversity of an old-forest associated lichen. Molecular Ecology, 15, 4: 911-921. doi: 10.1111/j.1365-294X.2006.02838.x
Holderegger, R.; Kamm, U.; Gugerli, F., 2006: Adaptive vs. neutral genetic diversity: implications for landscape genetics. Landscape Ecology, 21, 6: 797-807. doi: 10.1007/s10980-005-5245-9
Kéry, M.; Spillmann, J.H.; Truong, C.; Holderegger, R., 2006: How biased are estimates of extinction probability in revisitation studies?. Journal of Ecology, 94: 980-986. doi: 10.1111/j.1365-2745.2006.01151.x
Holderegger, R.; Angelone, S.; Brodbeck, S.; Csencsics, D.; Gugerli, F.; Hoebee, S.E.; Finkeldey, R., 2005: Application of genetic markers to the discrimination of pure European Black Poplar (Populus nigra) from American Black Poplar (P. deltoides) and Hybrid Poplars (P. x canadensis) in Switzerland. Trees: Structure and Function, 19, 6: 742-747. doi: 10.1007/s00468-005-0006-6
Holderegger, R., 2005: Frankham, R.; Ballou, J.D.; Briscoe, D.A., 2004: A primer of conservation genetics. Cambridge, Cambridge University Press. 220 pp. [book review]. Plant Systematics and Evolution, 255: 111-115. doi: 10.1007/s00606-005-0353-1
Schönswetter, P.; Stehlik, I.; Holderegger, R.; Tribsch, A., 2005: Molecular evidence for glacial refugia of mountain plants in the European Alps. Molecular Ecology, 14, 11: 3547-3555. doi: 10.1111/j.1365-294X.2005.02683.x
Holderegger, R.; Walser, J.; Gugerli, F.; Hoebee, S.E.; Scheidegger, C., 2005: Microsatellites reveal regional population differentiation and isolation in Lobaria pulmonaria, an epiphytic lichen. Molecular Ecology, 14, 2: 457-467. doi: 10.1111/j.1365-294x.2004.02423.x
Wagner, H.H.; Holderegger, R.; Werth, S.; Gugerli, F.; Hoebee, S.E.; Scheidegger, C., 2005: Variogram analysis of the spatial genetic structure of continuous populations using multilocus microsatellite data. Genetics, 169, 3: 1739-1752. doi: 10.1534/genetics.104.036038
Galeuchet, D.J.; Holderegger, R., 2005: Erhaltung und Wiederansiedlung des Kleinen Rohrkolbens (Typha minima) - Vegetationsaufnahmen, Monitoring und genetische Herkunftsanalysen. Botanica Helvetica, 115, 1: 15-32. doi: 10.1007/s00035-005-0704-0
Jaeger, J.; Holderegger, R., 2005: Schwellenwerte der Landschaftszerschneidung. GAIA: Ecological Perspectives for Science and Society, 14, 2: 113-118. doi: 10.14512/gaia.14.2.10
Walser, J.-C.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Kuonen, D.; Scheidegger, C., 2004: Recombination and clonal propagation in different populations of the lichen Lobaria pulmonaria. Heredity, 93, 4: 322-329. doi: 10.1038/sj.hdy.6800505
Wirth, L.R.; Schneller, J.; Holderegger, R., 2004: Ein vereinfachter Bestimmungsschlüssel für die Farne der Schweiz. Botanica Helvetica, 114, 1: 35-47.
Hilfiker, K.; Holderegger, R.; Rotach, P.; Gugerli, F., 2004: Dynamics of genetic variation in Taxus baccata: local versus regional perspectives. Canadian Journal of Botany, 82: 219-227. doi: 10.1139/B03-136
Hilfiker, K.; Gugerli, F.; Schütz, J.; Rotach, P.; Holderegger, R., 2004: Low RAPD variation and female-biased sex ratio indicate genetic drift in small populations of the dioecious conifer Taxus baccata in Switzerland. Conservation Genetics, 5, 3: 357-365. doi: 10.1023/B:COGE.0000031144.95293.1b
Holderegger, R., 2003: Körner, C.; Spehn, E.M. (eds) 2002: Mountain biodiversity. A global assessment. [book review]. Plant Systematics and Evolution, 240: 246-249. doi: 10.1007/s00606-003-0175-y
Holderegger, R.; Abbott, R.J., 2003: Phylogeography of the Arctic‐Alpine Saxifraga oppositifolia (Saxifragaceae) and some related taxa based on cpDNA and ITS sequence variation. American Journal of Botany, 90, 6: 931-936. doi: 10.3732/ajb.90.6.931
Holderegger, R.; Stehlik, I.; Smith, R.I.L.; Abbott, R.J., 2003: Populations of Antarctic hairgrass (Deschampsia antarctica) show low genetic diversity. Arctic, Antarctic, and Alpine Research, 35, 2: 214-217. doi: 10.1657/1523-0430(2003)035[0214:Poahda]2.0.Co;2
Landergott, U.; Kozlowski, G.; Schneller, J.J.; Holderegger, R., 2003: The importance of recent population history for understanding genetic diversity in threatened species, with special reference to Dryopteris cristata. Fern Gazette, 17, 1: 39-51.
Holderegger, R., 2002: De Nettancourt, D.: Incompatibility and incongruity in wild and cultivated plants. [book review]. Plant Systematics and Evolution, 232: 263-266. doi: 10.1007/s006060200048
Pfeifer, E.; Holderegger, R.; Matthies, D.; Rutishauser, R., 2002: Populationsbiologische Untersuchungen an einer Flaggschiff-Art der Magerrasen: Pulsatillavulgaris Mill. in der Nordostschweiz. Botanica Helvetica, 112, 2: 153-171.
Galeuchet, D.J.; Holderegger, R.; Rutishauser, R.; Schneller, J.J., 2002: Isozyme diversity and reproduction of Typha minima populations on the upper river Rhine. Aquatic Botany, 74, 1: 19-32. doi: 10.1016/S0304-3770(02)00021-9
Stehlik, I.; Blattner, F.R.; Holderegger, R.; Bachmann, K., 2002: Nunatak survival of the high Alpine plant Eritrichium nanum (L.) Gaudin in the central Alps during the ice ages. Molecular Ecology, 11, 10: 2027-2036. doi: 10.1046/j.1365-294X.2002.01595.x
Holderegger, R.; Stehlik, I.; Abbott, J., 2002: Molecular analysis of the Pleistocene history of Saxifraga oppositifolia in the Alps. Molecular Ecology, 11, 8: 1409-1418. doi: 10.1046/j.1365-294X.2002.01548.x
Landergott, U.; Holderegger, R.; Kozlowski, G.; Schneller, J.J., 2001: Historical bottlenecks decrease genetic diversity in natural populations of Dryopteris cristata. Heredity, 87: 344-355. doi: 10.1046/j.1365-2540.2001.00912.x
Gugerli, F.; Holderegger, R., 2001: Nunatak survival, tabula rasa and the influence of the Pleistocene ice-ages on plant evolution in mountain areas. Trends in Plant Science, 6, 9: 397-398. doi: 10.1016/S1360-1385(01)02053-2
Landergott, U.; Schneller, J.J.; Holderegger, R.; Kozlowski, G., 2000: Populationsgeschichte des seltenen Kammfarns (Dryopteris cristata) in der Schweiz. Botanica Helvetica, 110, 2: 151-170.
Von Flüe, I.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Schneller, J.J., 1999: Genetic and morphological variability in alpine Saxifraga oppositifolia L. after colonization. Feddes Repertorium, 110, 7-8: 555-559. doi: 10.1002/fedr.19991100716
Schneller, J.; Holderegger, R.; Gugerli, F.; Eichenberger, K.; Lutz, E., 1998: Patterns of genetic variation detected by RAPDs suggest a single origin with subsequent mutations and long‐distance dispersal in the apomictic fern Dryopteris remota (Dryopteridaceae) . American Journal of Botany, 85, 7: 1038-1042. doi: 10.2307/2446372
Further scientific publications
Bolliger, T.; Holderegger, R., 2020: Vegetationsgeschichte des Kantons. In: Zürcherische Botanische Gesellschaft; Wohlgemuth, T.; Del Fabbro, C.; Keel, A.; Kessler, M.; Nobis, M. (eds), 2020: Flora des Kantons Zürich. Bern, Haupt Verlag. 42-55.
Holderegger, R.; Spillmann, J.; Büttner, M., 2020: Auf 15 botanischen Exkursionen durch den Kanton. In: Zürcherische Botanische Gesellschaft; Wohlgemuth, T.; Del Fabbro, C.; Keel, A.; Kessler, M.; Nobis, M. (eds), 2020: Flora des Kantons Zürich. Bern, Haupt Verlag. 135-150.
Holderegger, R.; Bergamini, A.; Büttner, M.; Braig, P.; Landergott, U.; Info Flora, 2019: Seltene Pflanzen im Kanton Schaffhausen. Herkunft - Lebensräume - Gefährdung - Schutz. Neujahrsblatt der Naturforschenden Gesellschaft Schaffhausen, 71. 106 p.
Die Wirkungskontrolle Biotopschutz Schweiz (WBS) ist ein seit 2011 laufendes Programm des BAFU und der WSL. Sie untersucht mittels Luftbildinterpretation sowie floristischen und faunistischen Felderhebungen Veränderungen in den Biotopen von nationaler Bedeutung, den wichtigsten Knoten der Ökologischen Infrastruktur: Trockenwiesen und -weiden, Hoch- und Flachmoore, Auen (inklusive alpine Schwemmebenen und Gletschervorfelder) und Amphibienlaichgebiete.
Der neu entwickelte Werkzeugkasten Naturschutzgenetik bietet der Naturschutzpraxis Workflows an, welche es erlauben genetische Methoden im Naturschutz routinemässig einzusetzen. Hauptbestandteil des Werkzeugkastens sind einfache Workflows mit Anleitungen für das Probenahmedesign, das Sammeln von Proben, die Analysen im Labor, Auswertungen sowie Resultate und deren Interpretation.
Holderegger, R.; Küchler, M., 2018: Schlussfolgerungen für den Moorschutz in der Schweiz. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 241-245.
Bedolla, A., 2018: Regeneration von kleinen Hochmooren des Mittellandes. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 217-238.
Feldmeyer-Christe, E., 2018: Vegetationsdynamik als Folge einer Moorrutschung in La Vraconnaz. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 203-216.
Bergamini, A., 2018: Was nützen Nährstoffpufferzonen?. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bedolla, A.; Bergamini, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 197-202.
Küchler, H., 2018: Wiedervernässung Enzenau: ein Hochmoor erholt sich. In: Küchler, M.; Bergamini, A.; Küchler, H.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 185-196.
Graf, U.; Ecker, K., 2018: Das Gross Moos im Schwändital. In: Ecker, K.; Graf, U.; Holderegger, R.; Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Feldmeyer-Christe, E. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 163-184.
Küchler, M., 2018: Moorlandschaft und Schiessplatz Glaubenberg. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 151-162.
Küchler, M., 2018: Einfluss der Umgebung auf Moore. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 135-148.
Feldmeyer-Christe, E.; Küchler, M., 2018: Qualitätsveränderungen in Hochmooren: Bedeutung der Randzone. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 123-133.
Küchler, H., 2018: Entwicklung der Moore und ihrer Vegetation in der Schweiz. In: Küchler, M.; Bergamini, A.; Küchler, H.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 107-122.
Küchler, M., 2018: Erfassung von Zustand und Veränderungen von Mooren. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 93-106.
Küchler, H.; Graf, U., 2018: Torfmoose. In: Küchler, M.; Bergamini, A.; Küchler, H.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 79-92.
Küchler, M., 2018: Bedeutung der Moore für die Biodiversität in der Schweiz. In: Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 57-78.
Bedolla, A., 2018: Vegetationsdaten für die Moore der Schweiz. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 39-56.
Holderegger, R., 2018: Flächenrückgang der Moore in der Schweiz. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 27-38.
Holderegger, R., 2018: Einleitung. In: Küchler, M.; Küchler, H.; Bergamini, A.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Feldmeyer-Christe, E.; Graf, U.; Holderegger, R. (eds), 2018: Moore der Schweiz. Zustand, Entwicklung, Regeneration. Bern, Haupt. 15-24.
Die Moore der Schweiz sind im Wesentlichen seit der Annahme der Rothenthurm-Initiative im Jahr 1987 in ihrer Fläche geschützt. Doch wie steht es um sie heute? Und wie haben sich die Flach- und Hochmoore der Schweiz in den letzten 20 Jahren entwickelt? Viele Moore wurden in dieser Zeit regeneriert. Waren die entsprechenden Regenerationsmaßnahmen erfolgreich?
Unsere Ergebnisse aus der Umfrage zeigen, dass Fachleute im Naturschutz eine grosse Vielfalt an Informationsquellen nutzen. Der Bericht zeigt Handlungsmöglichkeiten auf, um den Austausch zwischen Wissenschaft und Praxis im Naturschutz effektiver zu gestalten.
Die Fauna Indicativa charakterisiert in Tabellenform ökologische Präferenzen und biologische Eigenschaften aller in der Schweiz einheimischen Libellen-, Heuschrecken-, Laufkäfer- und Tagfalterarten.
Holderegger, R.; Bollmann, K.; Brang, P.; Wohlgemuth, T., 2017: Auswirkungen des Douglasienanbaus auf die Biodiversität: wichtige Forschungsfragen (Essay). Schweizerische Zeitschrift für Forstwesen, 168, 1: 21-25. doi: 10.3188/szf.2017.0021
Hoeck, P.; Tobler, U.; Holderegger, R.; Bollman, K.; Keller, L., 2016: Populationsökologie: Fachbericht als Grundlage für die Ergänzung des Naturschutzgesamtkonzeptes des Kantons Zürich im Auftrag der Fachstelle Naturschutz, Amt für Landschaft und Natur. Zürich, Institut für Evolutionsbiologie und Umweltwissenschaften. 85 p.
Naturschutzgenetik ist eine verhältnismässig neue Teildisziplin der Ökologie, die schnell an Bedeutung für den Natur- und Artenschutz gewonnen hat. Mit ihrer Hilfe werden die genetischen Strukturen innerhalb von Populationen und ihre Veränderungen im Laufe der Populationsgeschichte untersucht.
Stöcklin, J.; Holderegger, R., 2016: Celebrating 125 years of Alpine Botany. Alpine Botany, 126, 2: 87. doi: 10.1007/s00035-016-0175-5
Der vorliegende Bericht schätzt das Biomasse- und Energiepotenzial folgender ausgesuchter Biotop- und Grünraumtypen im Kanton Zürich ab: Feuchtwiesen, Riedflächen, Strassenbegleitgrün (Autobahn, Kantonsstrassen), Bahnbegleitgrün, öffentliche Grünflächen im Siedlungsgebiet.
Bollmann, K.; Holderegger, R., 2016: Research gaps for a reliable assessment of the effects of Douglas fir on forest biodiversity. In: Krumm, F.; Vitková, L. (eds), 2016: Introduced tree species in European forests: opportunities and challenges. Freiburg, European Forest Institute. 284-285.
Gugerli, F.; Holderegger, R., 2016: Genetische Methoden. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 183-202.
Holderegger, R.; Segelbacher, G., 2016: Überblick. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 203-213.
Holderegger, R.; Segelbacher, G.; Widmer, A., 2016: Genetisches Monitoring. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 165-182.
Widmer, A.; Holderegger, R., 2016: Anpassung und Anpassungsfähigkeit. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 43-58.
Holderegger, R.; Segelbacher, G., 2016: Warum Genetik im Naturschutz?. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 13-24.
Segelbacher, G.; Holderegger, R., 2016: Genetische Vielfalt. In: Holderegger, R.; Segelbacher, G. (eds), 2016: Naturschutzgenetik: Ein Handbuch für die Praxis. Bern, Haupt. 25-42.
Bergamini, A.; Schnyder, N.; Lüth, M.; Hofmann, H.; Holderegger, R.; Kiebacher, T.; Müller, N., 2015: Beiträge zur bryofloristischen Erforschung der Schweiz - Folge 10. Meylania, 55: 16-29.
Gugerli, F.; Holderegger, R.; Bolliger, M., 2015: Genetic resources. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; Federal Office for the Environment; Swiss Federal Institute WSL (eds), 2015: Forest Report 2015. Condition and Use of Swiss Forests. Bern, Birmensdorf, Federal Office for the Environment (FOEN), Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research (WSL). 82-83.
Gugerli, F.; Holderegger, R.; Bolliger, M., 2015: Ressources génétiques. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; L’Office fédéral de l’environnement OFEV; Institut fédéral de recherches sur la forêt,la neige et le paysage WSL (eds), 2015: Rapport forestier 2015. État et utilisation de la forêt suisse. Berne, Office fédéral de l’environnement. 82-83.
Gugerli, F.; Holderegger, R.; Bolliger, M., 2015: Risorse genetiche. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; L’Office fédéral de l’environnement OFEV; Institut fédéral de recherches sur la forêt,la neige et le paysage WSL (eds), 2015: Rapport forestier 2015. État et utilisation de la forêt suisse. Berna, Office fédéral de l’environnement. 82-83.
Gugerli, F.; Holderegger, R.; Bolliger, M., 2015: Genetische Ressourcen. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; Bundesamt für Umwelt BAFU; Eidg. Forschungsanstalt für Wald,Schnee und Landschaft WSL (eds), 2015: Waldbericht 2015. Zustand und Nutzung des Schweizer Waldes. Bern, Birmensdorf, Bundesamt für Umwelt, Eidg. Forschungsanstalt für Wald, Schnee und Landschaft (WSL). 82-83.
Holderegger, R.; Imesch, N., 2015: Biodiversity. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; Federal Office for the Environment; Swiss Federal Institute WSL (eds), 2015: Forest Report 2015. Condition and Use of Swiss Forests. Bern, Birmensdorf, Federal Office for the Environment (FOEN), Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research (WSL). 69-69.
Holderegger, R.; Imesch, N., 2015: Biodiversità. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; Ufficio federale dell'ambiente; Istituto federale di ricerca WSL (eds), 2015: Rapporto forestale 2015. Stato e utilizzazione del bosco svizzero. Berna, Birmensdorf, Ufficio federale dell’ambiente (UFAM), Istituto federale di ricerca per la foresta, la neve e il paesaggio (WSL). 69-89.
Holderegger, R.; Imesch, N., 2015: Biodiversité. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; L’Office fédéral de l’environnement OFEV; Istitut fédéral de recherches sur la forêt,la neige et le paysage WSL (eds), 2015: Rapport forestier 2015. État et utilisation de la forêt suisse. Berne, Office fédéral de l'environnement. 69-89.
Holderegger, R.; Imesch, N., 2015: Biodiversität. In: Rigling, A.; Schaffer, H.P.; Bundesamt für Umwelt BAFU; Eidg. Forschungsanstalt für Wald,Schnee und Landschaft WSL (eds), 2015: Waldbericht 2015. Zustand und Nutzung des Schweizer Waldes. Bern, Birmensdorf, Bundesamt für Umwelt, Eidg. Forschungsanstalt für Wald, Schnee und Landschaft (WSL). 69-89.
Aavik, T.; Bosshard, D.; Edwards, P.; Holderegger, R.; Billeter, R., 2014: Effets de mélanges de semences sur la diversité génétique et la performance. Recherche Agronomique Suisse, 5, 1: 20-27.
Aavik, T.; Bosshard, D.; Edwards, P.; Holderegger, R.; Billeter, R., 2014: Genetische Vielfalt in Wildpflanzen-Samenmischungen. Agrarforschung Schweiz, 5, 1: 20-27.
Diese Literaturstudie fasst das aktuelle Wissen über die Auswirkungen der Douglasie auf die Biodiversität und die Lebensräume im Wald zusammen und zeigt Wissenslücken und Forschungsbedarf auf.
Manel, S.; Holderegger, R., 2014: Reply to Kershaw and Rosenbaum. Trends in Ecology and Evolution, 29, 2: 70-71. doi: 10.1016/j.tree.2013.12.009
Arrigo, N.; Holderegger, R.; Alvarez, N., 2012: Automated scoring of AFLPs using RawGeno v 2.0, a free R CRAN library. In: Pompanon, F.; Bonin, A. (eds), 2012: Data production and analysis in population genomics. New York, Humana Press. 155-175. doi: 10.1007/978-1-61779-870-2_10
Aavik, T.; Edwards, P.; Holderegger, R.; Billeter, R., 2012: The potential genetic consequences of seed mixtures. In: Swiss Federal Research Institute WSL (eds), 2012: ENHANCE. Enhancing ecosystem connectivity through intervention - benefits for nature and society? Final Report. Birmensdorf, Swiss Federal Research Institute WSL. 17-26.
Keller, D.; Van Strien, M.J.; Ghazoul, J.; Holderegger, R., 2012: Landscape genetics of insects in intensive agriculture: new ecological insights. In: Swiss Federal Research Institute WSL (eds), 2012: ENHANCE. Enhancing ecosystem connectivity through intervention - benefits for nature and society? Final Report. Birmensdorf, Swiss Federal Research Institute WSL. 27-35.
Bolliger, J.; Holderegger, R., 2012: Landscape genetics: key contributions from ENHANCE. In: Swiss Federal Research Institute WSL (eds), 2012: ENHANCE. Enhancing ecosystem connectivity through intervention - benefits for nature and society? Final Report. Birmensdorf, Swiss Federal Research Institute WSL. 11-12.
Le Lay, G.; Angelone, S.; Holderegger, R.; Flory, C.; Kienast, F.; Bolliger, J., 2012: The role of management intervention in enhancing breeding-habitat networks in the European tree frog. In: Swiss Federal Research Institute WSL (eds), 2012: ENHANCE. Enhancing ecosystem connectivity through intervention - benefits for nature and society? Final Report. Birmensdorf, Swiss Federal Research Institute WSL. 13-16.
Scheidegger, C.; Bergamini, A.; Bürgi, M.; Holderegger, R.; Lachat, T.; Schnyder, N.; Senn-Irlet, B.; Wermelinger, B.; Bollmann, K., 2011: Gestion forestière. In: Lachat, T.; Pauli, D.; Gonseth, Y.; Klaus, G.; Scheidegger, C.; Vittoz, P.; Walter, T. (eds), 2011: Evolution de la biodiversité en Suisse depuis 1900. Avons-nous touché le fond?. Zürich, Bristol-Stiftung; Bern, Stuttgart, Wien, Haupt. 124-160.
Di Giulio, M.; Holderegger, R.; Nobis, M.; Righetti, A.; Senn, J.; Stofer, S., 2011: Trafic et infrastructures de transport. In: Lachat, T.; Pauli, D.; Gonseth, Y.; Klaus, G.; Scheidegger, C.; Vittoz, P.; Walter, T. (eds), 2011: Evolution de la biodiversité en Suisse depuis 1900. Avons-nous touché le fond?. Zürich, Bristol-Stiftung; Bern, Stuttgart, Wien, Haupt. 264-295.
Angelone, S.; Flory, C.; Cigler, H.; Rieder-Schmid, J.; Wyss, A.; Kienast, F.; Holderegger, R., 2010: Erfolgreiche Habitatvernetzung für Laubfrösche. Vierteljahrsschrift der Naturforschenden Gesellschaft in Zürich, 155, 3-4: 43-50.
Tribsch, A.; Englisch, T.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Niklfeld, H.; Steinmann, K.; Thiel-Egenter, C.; Zimmermann, N.E.; Taberlet, P.; IntraBioDiv Consortium, 2010: Integrating data across biodiversity levels; the project IntraBioDiv. In: Spehn, E.M.; Körner, C. (eds), 2010: Data mining for global trends in mountain biodiversity. Boca Raton, CRC Press. 89-105.
Di Giulio, M.; Holderegger, R.; Nobis, M.; Righetti, A.; Senn, J.; Stofer, S., 2010: Verkehr und Verkehrsinfrastruktur. In: Lachat, T.; Pauli, D.; Gonseth, Y.; Klaus, G.; Scheidegger, C.; Vittoz, P.; Walter, T. (eds), 2010: Wandel der Biodiversität in der Schweiz seit 1900. Ist die Talsohle erreicht?. Zürich, Bristol-Stiftung; Bern, Stuttgart, Wien, Haupt. 266-297.
Scheidegger, C.; Bergamini, A.; Bürgi, M.; Holderegger, R.; Lachat, T.; Schnyder, N.; Senn-Irlet, B.; Wermelinger, B.; Bollmann, K., 2010: Waldwirtschaft. In: Lachat, T.; Pauli, D.; Gonseth, Y.; Klaus, G.; Scheidegger, C.; Vittoz, P.; Walter, T. (eds), 2010: Wandel der Biodiversität in der Schweiz seit 1900. Ist die Talsohle erreicht?. Zürich, Bristol-Stiftung; Bern, Stuttgart, Wien, Haupt. 124-160.
Häner, R.; Schierscher, B.; Kleijer, G.; Rometsch, S.; Holderegger, R., 2009: Mit Kulturpflanzen verwandte Wildarten erhalten. Agrarforschung, 16, 6: 204-209.
Holderegger, R., 2009: Book Review: Weber, E., 2009: Pflanzenleben der Schweiz / Swiss Plant Life. Bern, Haupt. 208 S. Botanica Helvetica, 119: 142-143.
Di Giulio, M.; Holderegger, R.; Bernhardt, M.; Tobias, S., 2008: Zerschneidung der Landschaft in dicht besiedelten Gebieten. Eine Literaturstudie zu den Wikungen auf Natur und Mensch und Lösungsansätze für die Praxis. Bristol-Schriftenreihe, 21. Berne, Haupt. 90 p.
Spillmann, J.H.; Holderegger, R., 2008: Die Alpenpflanzen des Tössberglandes. Einhundert Jahre nach Gustav Hegi. Bristol-Schriftenreihe, 22. Berne, Haupt. 220 p.
Holderegger, R., 2008: Book Review: Crawford, R.M.M. 2008: Plants at the Margin. Ecological Limits and Climate Change. Cambridge, Cambridge University Press. Botanica Helvetica, 118: 190-191.
Di Giulio, M.; Tobias, S.; Holderegger, R., 2008: Landschaftszerschneidung in Ballungsräumen. Was wissen wir über die Wirkungen auf Natur und Mensch?. Vierteljahrsschrift der Naturforschenden Gesellschaft in Zürich, 153, 1/2: 47-52.
Holderegger, R.; Wirth, L., 2007: Flora von Küsnacht und ihre Veränderung während der letzten zwei Jahrhunderte. Mit Florenlisten. Birmensdorf, Eidg. Forschungsanstalt für Wald, Schnee und Landschaft WSL. 43 p.
Suter, W.; Bollmann, K.; Holderegger, R., 2007: Landscape permeability: from individual dispersal to population persistence. In: Kienast, F.; Wildi, O.; Ghosh, S. (eds), 2007: A Changing World. Challenges for Landscape Research. Dordrecht, Springer. 157-174. doi: 10.1007/978-1-4020-4436-6_11
Holderegger, R.; Gugerli, F.; Scheidegger, C.; Taberlet, P., 2007: Integrating population genetics with landscape ecology to infer spatio-temporal processes. In: Kienast, F.; Wildi, O.; Ghosh, S. (eds), 2007: A Changing World. Challenges for Landscape Research. Dordrecht, Springer. 145-156. doi: 10.1007/978-1-4020-4436-6_10
Duelli, P.; Baur, P.; Buchecker, M.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Wohlgemuth, T., 2007: The role of value systems in biodiversity research. In: Kienast, F.; Wildi, O.; Ghosh, S. (eds), 2007: A Changing World. Challenges for Landscape Research. Dordrecht, Springer. 27-34. doi: 10.1007/978-1-4020-4436-6_3
Holderegger, R.; Wagner, H.H., 2006: A brief guide to landscape genetics. Landscape Ecology, 21, 6: 793-796. doi: 10.1007/s10980-005-6058-6
Dietschi, S.; Gehrig Schmidt, S.; Schwank, O.; Killer, V.; Holderegger, R., 2005: Qualität von Mähwiesen im Berggebiet. Agrarforschung, 12, 10: 466-471.
Magazine article and brochures
Boch, S.; Bedolla, A.; Ecker, K.T.; Ginzler, C.; Graf, U.; Küchler, H.; Küchler, M.; Moser, T.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2020: Grünlandqualität verschlechtert sich besonders in hohen Lagen - Ein Früherkennungssystem kann helfen. Anliegen Natur, 42, 2: 111-114.
Fabian, Y.; Holderegger, R.; Bollmann, K.; Brang, P.; Heiri, C.; Olschewski, R.; Rigling, A.; Stofer, S., 2020: Welche Informationsquellen nutzt die Naturschutzpraxis? Which information sources are used by professionals in nature conservation?. Natur und Landschaft, 95, 3: 179-184. doi: 10.17433/4.2020.50153795.179-184
Dähler, N.B.; Holderegger, R.; Braig, P.; Info Flora; Bergamini, A., 2020: Erhalten Schutzgebiete die Artenvielfalt? Les aires protégées préservent-elles la diversité des espèces?. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 32-36.
Bergamini, A.; Ginzler, C.; Schmidt, B.R.; Bedolla, A.; Boch, S.; Ecker, K.; Graf, U.; Küchler, M.; Dosch, O.; Holderegger, R., 2020: Wie verändern sich die Biotope von nationaler Bedeutung? Resultate aus der Ersterhebung der Wirkungskontrolle Biotopschutz Schweiz. Quelle évolutions connnaissent les biotopes d'importance nationale? Résultats de la première phase du suivi des effets de l. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 12-16.
Csencsics, D.; Dušej, G.; Holderegger, R.; Keller, D., 2019: Sind die Vorkommen des Lungenenzian-Ameisenbläulings vernetzt?. Les populations de l'azure des mouillères sont-elles interconnectées?. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 27-31.
Jamin, A.; Holderegger, R.; Gimmi, U.; Peintinger, M.; Bergamini, A., 2019: Aussterbeschuld in Zürcher Feuchtgebieten. Dette d'extinction dans les zones humides Zurichoises. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 24-27.
Bose, L.; Birrer, S.; Holderegger, R., 2019: Cultivating personal contacts. WSL magazine Diagonal, 2019, 2: 16-18.
Bose, L.; Birrer, S.; Holderegger, R., 2019: Soigner les relations. Magazine du WSL Diagonale, 2019, 2: 16-18.
Bose, L.; Birrer, S.; Holderegger, R., 2019: Persönliche Kontakte pflegen. WSL-Magazin Diagonal, 2019, 2: 16-17.
Boch, S.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Ginzler, C.; Graf, U.; Holderegger, R.; Küchler, H.; Küchler, M.; Bergamini, A., 2019: Wie steht es um die Biotope von nationaler Bedeutung?. FloraCH, 9: 4-6.
Fabian, Y.; Holderegger, R., 2018: Welche Informationsquellen nutzt die Naturschutzpraxis?. Nachrichten der Gesellschaft für Ökologie, 48, 2: 6-8.
Fabian, Y.; Holderegger, R.; Bollmann, K.; Brang, P.; Heiri, C.; Olschewski, R.; Rigling, A.; Stofer, S., 2018: Welche Informationsquellen nutzen Naturschutzfachleute?. Wald und Holz, 26-28.
Fabian, Y.; Holderegger, R.; Bollmann, K.; Brang, P.; Heiri, C.; Olschewski, R.; Rigling, A.; Stofer, S., 2018: Protection de la nature en forêt au défi d’une info efficace. Forêt, 15-18.
Fabian, Y.; Holderegger, R.; Bollmann, K.; Brang, P.; Heiri, C.; Olschewski, R.; Rigling, A.; Stofer, S., 2018: Welche Informationsquellen nutzt die Naturschutzpraxis in der Schweiz? Quelles sources d'information sur la protection de la nature sont utilisées en Suisse?. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 32-37.
Boch, S.; Ginzler, C.; Schmidt, B.R.; Bedolla, A.; Ecker, K.; Graf, U.; Küchler, H.; Küchler, M.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2018: Wirkt der Schutz von Biotopen? Ein Programm zum Monitoring der Biotope von nationaler Bedeutung in der Schweiz. Anliegen Natur, 40, 1: 39-48.
Klaiber, J.; Holderegger, R.; Bergamini, A., 2017: Die Fauna Indicativa - ein neues Werkzeug zur ökologischen Auswertung faunistischer Daten. Fauna Indicativa - un nouvel outil pour l'exploitation des données faunistiques en écologie. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 17-20.
Holderegger, R.; Spillmann, J.H.; Feldmeyer-Christe, E., 2017: Gewichtig - Gustav Hegi und die Illustrierte Flora von Mittel-Europa. Une oeuvre majeure - la flore illustrée d'Europe centrale de Gustav Hegi. info flora plus, 32-34.
Müller, G.; Holderegger, R.; Bürgi, M., 2016: Energie aus Landschaftspflegegrün. Énergie issue des déchets organiques des espaces verts. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 17 (1 pp.).
Holderegger, R., 2016: Fernsicht. Horizons. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 3.
Holderegger, R.; Gugerli, F.; Bolliger, J., 2016: Naturschutzgenetik für die Praxis. Génétique de la conservation pour la pratique. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 19.
Bergamini, A.; Ginzler, C.; Schmidt, B.R.; Küchler, M.; Holderegger, R., 2016: Die Wirkungskontrolle Biotopschutz Schweiz (WBS) in der Routinephase. Le «Suivi des effets de la protection des biotopes en Suisse» atteint son rythme de croisière. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 21-24.
Bürgi, M.; Holderegger, R., 2015: Biodiversitäts- und Landschaftsforschung an der WSL. Recherche sur la biodiversité et le paysage au WSL. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 13.
Holderegger, R.; Bolliger, M.; Gugerli, F., 2015: Jusqu'où les grains de pollen s'envolent-ils?. Forêt, 68, 2: 17-19.
Bollmann, K.; Tschopp, T.; Schmid, M.; Kaennel Dobbertin, M.; Reich, T.; Holderegger, R., 2015: Le douglas et la biodiversité forestière. Forêt, 68, 12: 18-19.
Bollmann, K.; Tschopp, T.; Schmid, M.; Kaennel Dobbertin, M.; Reich, T.; Holderegger, R., 2015: Ökologisch anders, aber kein "Totraum". Wald und Holz, 18-19.
Holderegger, R.; Bolliger, M.; Gugerli, F., 2015: Wie weit fliegen Pollenkörner?. Wald und Holz, 31-33.
Csencsics, D.; Holderegger, R., 2014: Kleiner Rohrkolben – genetische Grundlagen für erfolgreiche Wiederansiedlungen. La petite massette – bases génétiques pour une réintroduction réussie. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 21-25.
Dans le cadre du projet ENHANCE, des méthodes écologiques, génétiques et socio-économiques ont été mises en œuvre pour étudier l’influence d’un paysage agricole suisse, morcelé et intensivement exploité, sur la mise en réseau des habitats de diverses espèces animales et végétales.
Viele Pflanzen- und Tierarten profitieren von extensiv bewirtschafteten Landwirtschaftsflächen und einem Netz an ökologischen, qualitativ guten Ausgleichsflächen. Für Arten mit spezifischen Ansprüchen an ihren Lebensraum sind hingegen spezielle Massnahmen nötig.
Holderegger, R.; Angelone, S.; Csencsics, D., 2013: Wenn die Auswahl klein wird: der S-Allee Effekt. Informationsblatt Landschaft, 87: 4-5.
Keller, D.; Van Strien, M.J.; Holderegger, R., 2013: Landschaftsgenetik: Ausbreitung der Sumpfschrecke als Beispiel. Génétique du paysage: exemple par la propagation du criquet ensanglanté. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 20-23.
Bürgi, M.; Dalang, T.; Holderegger, R.; Diacon-Bolli, J., 2013: Die Nutzungsgeschichte der Halbtrockenrasen ist entscheidend für den Erhalt ihrer Artenvielfalt - Land-use history of calcareous grasslands is crucial for the conservation of their species diversity. Anliegen Natur, 35, 2: 40-43.
Segelbacher, G.; Holderegger, R., 2013: Ein neues jährliches Treffen in Conservation Genetics: Symposium im Januar 2015. Nachrichten der Gesellschaft für Ökologie, 43, 2: 13.
Gugerli, F.; Zimmermann, N.E.; Holderegger, R., 2013: Genetische Vielfalt. Die Alpen als Barriere und Schmelztiegel. Hotspot, 12-13.
Bergamini, A.; Ginzler, C.; Schmidt, B.R.; Küchler, M.; Holderegger, R., 2013: Wirkungskontrolle Biotopschutz Schweiz: Veränderungen sichtbar machen. Hotspot, 18-19.
Csencsics, D.; Rudow, A.; Holderegger, R., 2012: Die Schwarzpappel in der Schweiz: Verbreitung und Verjüngung. Le peuplier noir en Suisse: disséminaiton et régénération. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 15-20.
Bergamini, A.; Holderegger, R., 2012: Die Wirkungskontrolle Biotopschutz Schweiz: ein Monitoringprogramm im Aufbau. Suivi des effets de la protection des biotopes en Suisse: programme de monitoring en cours d'élaboration. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 14-20.
Holderegger, R., 2012: Draba ladina auch in Italien gefunden. info flora, 2.
Diacon, J.; Bürgi, M.; Holderegger, R.; Dalang, T., 2011: Einfluss der Bewirtschaftung auf Trockenrasen: ein systematischer Review. Effets de l'exploitation sur les pelouses sèches: recours à la méthode de la revue systématique. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 14-17.
Holderegger, R.; Stirnimann, T., 2011: Klare Frage, klare Antwort – systematische Reviews im N+L Bereich. Revue systématiques N+P – des réponses claires à des questions précises. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 12-15.
Hepenstrick, D.; Gugerli, F.; Holderegger, R.; Senn, J.; Gremminger, T.; Thiel, D., 2010: Fragmentierung in einem Wildtierkorridor von nationaler Bedeutung. Fragmentation dans un couloir faunistique d'importance nationale. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 21-23.
Holderegger, R., 2010: 20 Minuten Natur + Landschaft. Wie gelangt die Praxis an Forschungsresultate?. Informationsblatt Landschaft, 79: 1-2.
Wirth, L.; Holderegger, R., 2010: Une pour toutes, toutes pour une! Les plantes des Alpes s'entraident-elles?. Alpen, 46-47.
Wirth, L.; Holderegger, R., 2010: Gemeinsam statt einsam: Helfen sich Alpenpflanzen gegenseitig?. Alpen, 46-47.
Angelone, S.; Kienast, F.; Holderegger, R.; Flory, C.; Cigler, H.; Rieder-Schmid, J.; Wyss, A., 2009: Laubfrosch und Vernetzungsprojekte: eine Erfolgsgeschichte. Nature + Paysage. Natur + Landschaft: Inside, 31-34.
Hilfiker, K.; Gugerli, F.; Holderegger, R., 2009: Ist das Geschlechterverhältnis der Eibe von praktischer Bedeutung?. Eibenfreund, 74-77.
La petite massette est une plante menacée dont l’habitat originel était lié aux paysages fluviaux des pays alpins. Nous présentons cet habitant rare des zones alluviales et précisons les connaissances actuelles sur sa répartition, ses exigences écologiques, les données biologiques et génétiques de base, les projets de réintroduction. Nous en déduisons des instructions d’action pour protéger la petite massette.
Der Kleine Rohrkolben ist eine gefährdete Pflanzenart, die ursprünglich in Wildflusslandschaften in den Alpenländern beheimatet war: aktuelle Kenntnisse zu Verbreitung, Lebensraumansprüchen, biologischem und genetischem Hintergrund sowie zu Wiederansiedlungsprojekten und Schutz des Kleinen Rohrkolbens.
Csencsics, D.; Holderegger, R., 2008: Le peuplier noir bénéficie des revitalisations de cours d'eau. Forêt, 61, 11: 22-24.
Csencsics, D.; Holderegger, R., 2008: Die Schwarzpappel profitiert von Flussrevitalisierungen. Genetische Tests im Auenwald. Wald und Holz, 89, 11: 52-54.
Määttänen, K.; Holderegger, R., 2008: Histoire et conservation des peuplements de poiriers sauvages en Suisse: Il faut encourager les peuplements grâce à d'anciennes formes d'exploitation. Forêt, 61, 4: 20-23.
Holderegger, R.; Wirth, L., 2007: Die Flora der Gemeinde Küsnacht und ihre Veränderung während der letzten zwei Jahrhunderte. Küsnachter Jahrheft, 47: 34-50.
Holderegger, R.; Di Giulio, M., 2007: Grünbrücken funktionieren gut! Aber was heisst das?. Informationsblatt Landschaft, 66: 4-5.
Kenntnisstand zu den Auswirkungen der Landschaftszerschneidung aus ökologischer und sozialwissenschaftlicher Sicht.
L’état des connaissances sur les conséquences de la fragmentation du paysage dans les espaces périurbains, d’un point de vue écologique et sociologique.
Määttänen, K.; Holderegger, R., 2007: Geschichte und Erhaltung von Wildbirnenbeständen in der Schweiz: Fördern mit alten Nutzungsformen. Wald und Holz, 88, 9: 54-56.
Holderegger, R.; Gugerli, F., 2006: Moderne Forschung ist auf Sammlungen angewiesen. Hotspot, 13.
Holderegger, R., 2006: Are royal families of conservation concern?. Genetics Society News, 40-41.
Csencsics, D.; Angelone, S.; Holderegger, R., 2006: Le peuplier noir est l'arbre de l'année. Un coup d'oeil dans le laboratoire de génétique: est-il authentique ou pas?. Forêt, 59, 5: 22-24.
Häner, R.; Hoebee, S.E.; Holderegger, R., 2006: Les peuplements de poiriers sauvages: petits ... mais précieux. Forêt, 59, 3: 12-14.
Gugerli, F.; Brodbeck, S.; Holderegger, R., 2005: Die unerträgliche Leichtigkeit, eine reine Eiche zu sein. Blattmorphologie und genetischer Fingerabdruck als unterschiedlich einsetzbare Bestimmungshilfen. Informationsblatt Landschaft, 63: 1-5.
Csencsics, D.; Angelone, S.; Holderegger, R., 2005: Blick ins Genetik-Labor: Schwarzpappel oder nicht?. Informationsblatt Wald, 20: 4-6.
Holderegger, R., 2005: Sag mir, wo die Schwarzpappeln sind. Gartenbau: Schweizer Fachmagazin, 29.
Wirth, L.R.; Holderegger, R., 2005: L'alisier aime prendre ses distances. Forêt, 58, 5: 10-12.
Wirth, L.R.; Hoebee, S.E.; Arnold, U.; Düggelin, C.; Brodbeck, S.; Rotach, P.; Gugerli, F.; Holderegger, R., 2005: Ausbreitung der Elsbeerpollen. Destination unbekannt?. Corminaria, 3-5.
Häner, R.; Hoebee, S.E.; Holderegger, R., 2005: Naturschutzgenetik der Wildbirne (Pyrus pyraster). Wildbirnenbestände - klein aber fein?. Wald und Holz, 86, 5: 29-32.
Wirth, L.R.; Angelone, S.; Hoebee, S.E.; Arnold, U.; Düggelin, C.; Hilfiker, K.; Brodbeck, S.; Gugerli, F.; Holderegger, R., 2005: Die Elsbeere (Sorbus torminalis). Fruchtbarkeit trotz Einsamkeit. Wald und Holz, 86, 2: 33-35.
Hilfiker, K.; Ulber, M.; Gugerli, F.; Rotach, P.; Bonfils, P.; Holderegger, R., 2004: Comment promouvoir et régénérer l'if en Suisse?. Forêt, 57, 1: 11-13.
Bernhard, S.; Holderegger, R., 2004: Genetische Vielfalt - Lebensversicherung des Waldes. Hotspot, 14-15.
Hilfiker, K.; Ulber, M.; Gugerli, F.; Rotach, P.; Bonfils, P.; Holderegger, R., 2003: In kleinen Eibenpopulationen: Mehr Weibchen als Männchen. Wald und Holz, 84, 2: 44-46.
Holderegger, R.; Arnold, U.; Bonfils, P.; Dounavi, A.; Finkeldey, R.; Gugerli, F.; Hilfiker, K.; Hoebee, S.; Rotach, P.; Studhalter, S.; Ulber, M., 2002: WSL-Forschungsprojekte zu seltenen Baumarten in der Abteilung Genetische Ökologie, insbesondere der Elsbeere. Corminaria, 11.
Studhalter, S.; Holderegger, R., 2002: L'alisier torminal et la recherche au WSL. Forêt, 55, 2: 23-25.
Studhalter, S.; Holderegger, R., 2001: Forschung zur Elsbeere an der WSL. Wald und Holz, 82, 12: 40-42.